Způsob detekce molekul RNA polyadenylovaných na 3´ konci a molekul RNA, které obsahují uvnitř řetězce úseky těsně za sebou následujících adeninů, za použití 5-bromo-2´-deoxyuridinu, 5-iodo-2´-deoxyuridinu a 5-chloro-2´-deoxyuridinu ve formě trifosfátů v permeabilizovaných buňkách a tkáních a na řezech buňkami nebo tkáněmi

0369764 - ÚEM 2012 RIV cze P - Patent Document
Koberna, Karel - Rosenberg, Ivan - Ligasová, Anna - Liboska, Radek
Způsob detekce molekul RNA polyadenylovaných na 3´ konci a molekul RNA, které obsahují uvnitř řetězce úseky těsně za sebou následujících adeninů, za použití 5-bromo-2´-deoxyuridinu, 5-iodo-2´-deoxyuridinu a 5-chloro-2´-deoxyuridinu ve formě trifosfátů v permeabilizovaných buňkách a tkáních a na řezech buňkami nebo tkáněmi.
[Method for the detection of RNA molecules polyadenylated at the 3´ end and RNA molecules containing inner parts composed of several adenines by means of 5-bromo-2´-deoxyuridine, 5-iodo-2´-deoxyuridine and 5-chloro-2´-deoxyuridine in the triphosphate form in the permeabilised cells and tissues and on the sections of cells and tissues.]
2011. Owner: Ústav experimentální medicíny AVČR, v. v. i., Ústav organické chemie a biochemie AVČR, v. v. i. Date of the patent acceptance: 23.06.2011. Patent Number: 302613
R&D Projects: GA ČR GA204/09/0973; GA AV ČR KAN200520801
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50390512; CEZ:AV0Z40550506
Keywords : DNA * RNA
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
http://spisy.upv.cz/Patents/FullDocuments/302/302613.pdf

Popsané metody umožňují efektivní detekci polyadenylované RNA a rovněž RNA, která obsahuje uvnitř řetězce části s několika za sebou těsně následujícími adeniny. Popsaná metoda umožňuje specifickou detekci produktů reverzní transkripce v RNA-DNA duplexech a maskování těchto produktů v DNA-DNA duplexech. Metoda je založena na značení pomocí BrdUTP, CldUTP a IdUTP, které jsou „neviditelné“ v DNA-DNA duplexech, ale jednoduše detekovatelné v RNA-DNA duplexech.

The described method enables effective detection of polyadenylated RNA and also RNA, which contain inside their chains parts with the several following adenines. The described method enables specific detection of products of reverse transcription in RNA-DNA duplexes and masking of these products in DNA-DNA duplexes. The approach is based on the BrdUTP, CldUTP and IdUTP labelling, which are „invisible“ in DNA-DNA duplexes and easily detectable in RNA-DNA duplexes.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0203757