Kinetoplastid guide RNA biogenesis is dependent on subunits of the mitochondrial RNA binding complex 1 and mitochondrial RNA polymerase

0334909 - BC 2010 RIV US eng J - Journal Article
Hashimi, Hassan - Číčová, Zdeňka - Novotná, Lucie - Wen, Y.-Z. - Lukeš, Julius
Kinetoplastid guide RNA biogenesis is dependent on subunits of the mitochondrial RNA binding complex 1 and mitochondrial RNA polymerase.
[Biogeneze kinetoplastidové guide RNA závisí na podjednotkách mitochondriálního RNA vazebného komplexu 1 a na mitochondriální RNA polymeráze.]
RNA. Roč. 15, č. 4 (2009), s. 588-599. ISSN 1355-8382. E-ISSN 1469-9001
R&D Projects: GA ČR GA204/09/1667; GA AV ČR IAA500960705; GA MŠMT LC07032; GA MŠMT 2B06129; GA ČR GD524/03/H133
Institutional research plan: CEZ:AV0Z60220518
Keywords : RNA editing * guide RNA * mitochondrion * trypanosome
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 5.198, year: 2009

The mitochondrial RNA binding complex 1 (MRB1) is a recently discovered set of proteins associated with the TbRGG1 in Trypanosoma brucei. Based on the phenotype caused by downregulation of this protein, it was proposed to play an unspecified RNA editing role. RNAi-silencing of three newly characterized protein subunits, guide RNA associated proteins (GAPs) 1 and 2 plus a predicted RNA helicase, show they are essential for cell growth in the insect stage. Furthermore, their downregulation leads to inhibition of editing in only those mRNAs for which minicircle-encoded guide (g) RNAs are required. All three proteins are necessary for the expression of the minicircle-encoded gRNAs. Moreover, down-regulation of a fourth assayed putative MRB1 subunit, Nudix hydrolase, does not appear to destabilize gRNAs but has a general impact on the stability of maxicircle-encoded RNAs. We also demonstrate that the same mt RNA polymerase may also have a role in expression of the minicircle-encoded gRNAs.

Mitochondriální vazebný komplex 1 (MRB1) byl objeven jako komplex proteinů spojovaný s proteiny TbRGG1 u Trypanosomy brucei. Na základě fenotypu, který způsobuje pokles množství tohoto proteinu, bylo míněno, že hrají nespecifickou roli v editování RNA. RNAi umlčování třech nově charakterizovaných proteinových podjednotek, guide RNA spojována s proteiny (GAPs) 1 a 2, a RNA helikázy, ukázalo, že jsou nepostradatelné pro růst buněk v hmyzí stádiu. Navíc, jejich down-regulace vede k inhibici editování dochází pouze u těch mRNA, pro které jsou vyžadovány minikroužky kódováné guide (g) RNA. Všechny tři proteiny jsou nezbytné pro expresi minikroužky kódovaných gRNA. Kromě toho, down-regulaci čtvrté kontrolované MRB1 podjednotky, nudix hydrolázy, se nezdá, že by destabilizovaly gRNA a že by down-regulace tohoto proteinu měla obecný dopad na stabilitu maxikroužky kódovanou RNA. Nakonec jsme ukázali, že stejná mtRNA polymeráza, může mít také roli v expresi minikroužky kódováných gRNA.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0179518