Comprehensive cross-amplification of microsatellite multiplex sets across the rodent genus Microtus

0320177 - ÚBO 2009 RIV GB eng J - Journal Article
Rudá, M. - Žiak, D. - Gauffre, B. - Zima, Jan - Martínková, Natália
Comprehensive cross-amplification of microsatellite multiplex sets across the rodent genus Microtus.
[Obsáhlá amplifikace multiplexových setů mikrosatelitů mezi druhy hlodavců rodu Microtus.]
Molecular Ecology Resources. Roč. 9, č. 3 (2009), s. 974-978. ISSN 1755-098X. E-ISSN 1755-0998
R&D Projects: GA AV ČR KJB600930610
Grant - others:VEGA(SK) 1/3264/2006
Institutional research plan: CEZ:AV0Z60930519
Keywords : Arvicolinae * cross-amplification * microsatellite * Microtus * STR
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 1.251, year: 2009

We developed four multiplex panels comprising 19 microsatellite loci and tested their amplification in 21 rodent species important for agricultural and conservation management (Microtus, Arvicola, Chionomys). On average, 17.6 loci amplified per species. Number of alleles ranged from 1 to 19 per locus. We report an additional locus polymorphic in 15 vole species.

Vytvořili jsme čtyři multiplexové panely, které zahrnovaly 19 mikrosatelitových lokusů, a testovali jsme je na 21 druzích hlodavců (Microtus, Arvicola, Chionomys), kteří jsou důležití z hlediska zemědělského a ochranářského managementu. V průměru se amplifikovalo 17.6 lokusů u každého druhu. Počet alel se různil od 1 do 19 na lokus. Publikujeme navíc jeden lokus, který byl polymorfní u 15 druhů hrabošů.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0169125