Role of loops in the guanine quadruplex formation by DNA/RNA hybrid analogs of G4T4G4

0319192 - BFÚ 2009 RIV GB eng J - Journal Article
Vondrušková, Jitka - Kypr, Jaroslav - Kejnovská, Iva - Fialová, Markéta - Vorlíčková, Michaela
Role of loops in the guanine quadruplex formation by DNA/RNA hybrid analogs of G4T4G4.
[Role loopu na uspořádání guaninového tetraplexu DNA/RNA hybridních analogů G4T4G4.]
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 43, č. 5 (2008), s. 463-467. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA204/07/0057; GA AV ČR(CZ) IAA100040701
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Keywords : nucleic acids * RNA/DNA hybrids * guanine quadruplexes
Subject RIV: BO - Biophysics
Impact factor: 1.867, year: 2008

CD spectroscopy, gel electrophoresis and absorption-based thermal stability were used to analyze quadruplex formation of RNA and RNA/DNA hybrid analogs of the deoxyoligonucleotide G4T4G4, which forms a well-characterized basket-type quadruplex. All RNA-containing dodecamers, g4u4g4, G4u4G4 and g4T4g4 (RNA lower-case, DNA capital letters), formed parallel, namely tetramolecular quadruplexes in Na+-containing solutions.

Použitím CD spektroskopie, gelové elektroforézy a termální analýza jsme studovali uspořádání guaninového tetraplexu u RNA a RNA/DNA hybridních analogů G4T4G4. Všechna RNA obsahující dodekamery, g4u4g4, G4u4G4 a g4T4g4, tvoří v Na+ obsahujících roztocích paralelní tetramolekulární tetraplexy.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0168418