An effect of 16S rRNA intercistronic variability on coevolutionary analysis in symbiotic bacteria: Molecular phylogeny of Arsenophonus triatominarum

0319110 - BC 2009 RIV DE eng J - Journal Article
Šorfová, Pavlína - Škeříková, Andrea - Hypša, Václav
An effect of 16S rRNA intercistronic variability on coevolutionary analysis in symbiotic bacteria: Molecular phylogeny of Arsenophonus triatominarum.
[Vliv intercistronické variability 16S RNA na koevoluční analýzu symbiotických bakterií: molekulární fylogeneze bakterie Arsenophonus triatominarum.]
Systematic and Applied Microbiology. Roč. 31, č. 2 (2008), s. 88-100. ISSN 0723-2020. E-ISSN 1618-0984
R&D Projects: GA ČR GA206/04/0520; GA AV ČR IAA601410708
Institutional research plan: CEZ:AV0Z60220518
Keywords : intragenomic heterogeneity * 16S rRNA * coevolution * insect symbionts * molecular phylogeny
Subject RIV: EE - Microbiology, Virology
Impact factor: 2.582, year: 2008

In this study, we show that in Arsenophonus triatominarum the degree of heterogeneity can affect reconstruction of phylogenetic relationships and mask possible coevolution between the symbiont and its host. Phylogenetic arrangement of individual rRNA copies was used, together with a calculation of their divergence time, to demonstrate that the incongruent 16S rDNA trees and low nucleotide diversity in the secondary symbiont could be reconciled with the coevolutionary scenario.

Studie ukazuje na příkladu symbiotické bakterie Arsenophonus triatominarum, že vnitrogenomová variabilita může ovlivňovat rekonstrukci fylogenetických vztahů a zakrýt případnou koevoluci mezi symbiontem a hostitelem. Fylogenetické uspořádání 16S RNA, společně s výpočtem divergenčních časů, ukazuje, že inkongruence mezi 16S RNA stromy a nízká genetická diverzita mohou být v souladu s koevoluční hypotézou.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0168362