Eucaryotic operon genes can define highly conserved syntenies

0105331 - UMG-J 20043121 RIV CZ eng J - Journal Article
Trachtulec, Zdeněk
Eucaryotic operon genes can define highly conserved syntenies.
[Eukaryotické operonové geny mohou definovat vysoce konzervované syntenie.]
Folia Biologica. Roč. 50, - (2004), s. 1-6. ISSN 0015-5500. E-ISSN 0015-5500
R&D Projects: GA ČR GA204/01/0997; GA MŠMT LN00A079
Institutional research plan: CEZ:AV0Z5052915
Keywords : eukaryotic operon * conserved synteny
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 0.507, year: 2004

The synteny conservation of the members of eukaryotic operons was investigated by mapping their orthologues in Drosophila, human, and other eukaryotes. While the homologues of the operon members are generally not linked, some examples of highly conserved syntenies were found. The most significant synteny involves two members of one C. elegans operon, encoding fibrillarin and ribosomal protein S16. Their homologues are linked in human, mouse, Drosophila, Anopheles gambiae, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Plasmodium falciparum, and Guillardia theta, but not in five other genomes. The distances between the genes are larger than in the nematode, suggesting the prevalence of intrachromosomal rearrangements

Bylo studováno zachování syntenie u členů eukaryotických operonů mapováním jejich ortologů u Drosophily, člověka a dalších eukaryot. Zatímco homology členů operonů obvykle nejsou spojeny, byly nalezeny některé příklady vysoce konzervovaných syntenií. Nejvýznamnější syntenie se týká dvou členů jednoho operonu C. elegans kódujícího fibrillarin a ribozomální protein S16. Jejich homology jsou u člověka, myši, Drosophily, Anopheles gambiae, Saccharomyces cerevisias a Guillardia theta spojeny, ale u dalších pěti genomů ne. Vzdálenosti mezi geny jsou větší než u nematodů, což naznačuje, že došlo k rozsáhlejším přestavbám uvnitř chromozomu
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0012574