Phylogenetic relationships within Luzula DC. and Juncus L. (Juncaceae): A comparison of phylogenetic signals of trnL-trnF intergenic spacer, trnL intron and rbcL plastome sequence data

0048226 - BÚ 2007 RIV GB eng J - Journal Article
Drábková, Lenka - Kirschner, Jan - Vlček, Čestmír
Phylogenetic relationships within Luzula DC. and Juncus L. (Juncaceae): A comparison of phylogenetic signals of trnL-trnF intergenic spacer, trnL intron and rbcL plastome sequence data.
[Fylogenetické vztahy uvnitř rodů Luzula a Juncus (Juncaceae): Srovnání fylogenetického signálu trnL-trnF intergenového spaceru, trnL intronu a rbcL chloroplastových sekvenčních dat.]
Cladistics. Roč. 22, č. 2 (2006), s. 132-143. ISSN 0748-3007. E-ISSN 1096-0031
R&D Projects: GA ČR GA206/02/0355
Institutional research plan: CEZ:AV0Z60050516; CEZ:AV0Z50520514
Keywords : Luzula * Juncus * Juncaceae
Subject RIV: EF - Botanics
Impact factor: 4.270, year: 2006

Relationships within Juncus and Luzula and among other genera of Juncaceae (Distichia, Marsippospermum, Oxychloë, Patosia, and Rostkovia) were resolved based on plastome sequence data. The parsimony analyses revealed several well-supported lineages. Traditionally distinguished genus Luzula is monophyletic and Juncus is non-monophyletic. Two subgenera of Luzula (Pterodes and Luzula) are non-monophyletic, while subg. Marlenia forms a sister group to the whole Luzula clade (trnL-F data set). Within Juncus, both subgenus Juncus and subgenus Agathryon are non-monophyletic. Southern Hemisphere Clade (SHC) is clustered not only with South African J. lomatophylus and J. capensis, but also together with members of sect. Juncus, Caespitosi and Graminifolii. Nevertheless, these sections form a well-separated sister group to SHC. Within the genera Juncus and Luzula, monophyly demonstrated for a number of groups (e.g., Juncus sect. Stygiopsis, Luzula sect. Luzula) and questioned the monophyly of others (e.g., Juncus sect. Graminifolii). Separate unusual position of Juncus trifidus and also J. monanthos were clarified by trnL-trnF sequence data, but varies within the tree topology depending on outgroup selection.

Byly řešeny fylogenetické vztahy mezi druhy rodů Juncus a Luzula a mezi ostatními rody čeledi Juncaceae (Distichia, Marsippospermum, Oxychloë, Patosia, and Rostkovia) na základě sekvencí chloroplastové DNA. Analýza parsimonie odhalila několik linií s dobrou statistickou podporou. Rod Luzula je monofyletický a u rodu Juncus nebyla monofylie potvrzena. Dva podrody bik (Pterodes and Luzula) jsou nemonofyletické, zatímco subg. Marlenia tvoří sesterskou skupinu pro celý rod Luzula (trnL-F). Uvnitř rodu Juncus získaná data potvrdila, že podrody Juncus a Agathryon jsou nemonofyletické.Sesterskou skupinu jihohemisférové větve kromě jihoafrických J. lomatophylus a J. capensis tvoří zástupci sekcí Juncus, Caespitosi and Graminifolii. Uvnitř rodu Juncus a Luzula byla potvrzena monofylie skupin Juncus sect. Stygiopsis, Luzula sect. Luzula, nicméně otázkou zůstává monofylie Juncus sect. Graminifolii. Odčlenění Juncus trifidus a J. monanthos bylo sekvenčními daty z úseku trnL-trnF potvrzeno, ačkoli pozice obou druhů v topologii stromu je závislá na výběru kořene stromu.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0138912