Calculation of Structural Behavior of Indirect NMR Spin-Spin Couplings in the Backbone of Nucleic Acids

0043157 - ÚOCHB 2007 RIV US eng J - Journal Article
Sychrovský, Vladimír - Vokáčová, Zuzana - Šponer, Jiří - Špačková, Naďa - Schneider, Bohdan
Calculation of Structural Behavior of Indirect NMR Spin-Spin Couplings in the Backbone of Nucleic Acids.
[Výpočty strukturního chování spin-spinových štěpících konstant mezi atomy páteře nukleových kyselin.]
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 110, č. 45 (2006), s. 22894-22902. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA203/05/0388; GA MŠMT(CZ) LC512
Grant - others:NSF(US) DBI 0110076
Institutional research plan: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50040507
Keywords : nucleic acids * RNA * DNA * molecular structure
Subject RIV: CF - Physical ; Theoretical Chemistry
Impact factor: 4.115, year: 2006

Values of indirect NMR spin-spin coupling constants between 31P, 13C, and 1H nuclei calculated by high-level quantum mechanics were related to the backbone torsion angles of nucleic acids. It was shown that the coupling constants can facilitate accurate and reliable structural interpretation of NMR measurements and help to discriminate between distinct conformational classes of nucleic acids.

Vypočtené NMR spin-spinové štěpící konstanty mezi jádry 31P, 13C a 1H byly korelovány s torzními úhly pro atomy podél páteře nukleových kyselin. Bylo ukázáno, že štěpící konstanty lze použít k přesné a spolehlivé interpretaci NMR experimentů a s jejich pomocí lze rozlišit různé konformační třídy nukleových kyselin.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0003678