Investigating oligonucleotide hybridization at subnanomolar level by surface plasmon resonance biosensor method

0040514 - ÚFE 2007 RIV US eng J - Journal Article
Vaisocherová, Hana - Zítová, Alice - Lachmanová, Markéta - Štepánek, J. - Králíková, Šárka - Liboska, Radek - Rejman, Dominik - Rosenberg, Ivan - Homola, Jiří
Investigating oligonucleotide hybridization at subnanomolar level by surface plasmon resonance biosensor method.
[Výzkum interakcí oligonukleotidů na subnanomolární úrovni pomocí senzoru s povrchovými plazmony.]
Biopolymers. Roč. 82, č. 4 (2006), s. 394-398. ISSN 0006-3525. E-ISSN 1097-0282.
[European Conference on the Spectroscopy of Biological Molecules - ECSBM 2005 /11./. Aschaffenburg, 03.09.2005-08.09.2005]
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA303/03/0249; GA ČR(CZ) GA102/03/0633; GA ČR(CZ) GA202/05/0628
Institutional research plan: CEZ:AV0Z20670512; CEZ:AV0Z40550506
Keywords : surface plasmon resonance * biosensors * optical sensors
Subject RIV: BO - Biophysics
Impact factor: 2.480, year: 2006

We optimized surface plasmon resonance (SPR) biosensor for a rapid, direct, sensitive and label-free screening of synthetic oligonucleotides (ONs) with modified structure potentially applicable in antisense therapy. An optimized immobilization method was employed to obtain desired ligand density and hybridization efficiency. It was showed that the sensor is capable of detecting ONs in concentrations as low as 0.1 nM with high specificity and reproducibility.

Senzor s povrchovými plazmony byl optimalizován pro přímou, rychlou a citlivou detekci série syntetických oligonukleotidů s modifikovanou strukturou, které mají potenciál využití v antisensní terapii. Použitá imobilizační metoda byla optimalizována pro dosažení cílené povrchové hustoty a efektivity hybridizace. Pomocí vyvinutého senzoru bylo možné specificky a vysoce reprodukovatelně detekovat oligonukleotidy o koncentraci >=0.1nM.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0134224