Hinge-like motions in RNA Kink-turns: The role of the second A-minor motif and nominally unpaired bases

0021289 - BFÚ 2006 RIV US eng A - Abstract
Rázga, Filip - Koča, Jaroslav - Leontis, Neocles B. - Šponer, Jiří
Hinge-like motions in RNA Kink-turns: The role of the second A-minor motif and nominally unpaired bases.
[Kloubové pohyby RNA Kink-turnů: Úloha druhého A-minor motivu a formálně nespárovaných nukleotidů.]
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. Taylor & Francis. Roč. 22, - (2005), s. 800-801. ISSN 0739-1102.
[The 14th Conversation. 14.06.2005-18.06.2005, Albany]
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50040507
Keywords : Kink-turns * A-minor * RNAs
Subject RIV: BO - Biophysics

The nanosecond molecular dynamics of isolated ribosomal Kink-turn motifs can be qualitatively considered as motion of two rigid helix stems controlled by a very flexible internal loop which then leads to substantial hinge-like motions between the two stems.

Molekulární dynamika (nanosekundová časová škála) izolovaných ribozomální Kink-turn motivů může být kvalitativně považována za pohyb dvou rigidních helikálních segmentů řízených velmi flexibilní vnitřní smyčkou která potom vede k podstatným kloubovým pohybům mezi těmito helikálními segmenty.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0110282