GUHA Analysis of Proteomic Oncological Data

0093686 - ÚI 2008 RIV CZ eng J - Journal Article
Coufal, David - Vydra, J. - Selicharová, Irena
GUHA Analysis of Proteomic Oncological Data.
[Analýza proteomických onkologických dat metodou GUHA.]
Neural Network World. Roč. 17, č. 5 (2007), s. 447-457. ISSN 1210-0552
R&D Projects: GA MZd NR8323
Institutional research plan: CEZ:AV0Z10300504; CEZ:AV0Z40550506
Keywords : data mining * proteomic analysis * breast cancer
Subject RIV: IN - Informatics, Computer Science
Impact factor: 0.280, year: 2007

The paper presents results of GUHA analysis of proteomic data. The data are related to an oncological study on breast cancer and are given by 2D electrophoresis gels carrying expression intensity of proteins in cancer cells. The gels have been classified by a physician according to the clinical course of the tumor disease. A research task is aimed on search for significant relations between protein spot intensities and respective clinical presentation. The task was solved by the GUHA method of data mining.

Článek referuje výsledky analýzy proteomických dat metodou GUHA. Analyzovanými daty jsou popisy 2D elektroforetických gelů nesoucí informaci o míře exprese bílkovin v proteomu nádorových buněk rakoviny prsu. Gely jsou klasifikovány na základě klinických obrazů pacientek a průběhu nádorového onemocnění. Cílem analýz je identifikace bílkovin, které mají statisticky významný vztah k příslušným klinickým obrazům.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0004369