Web Tool for Photobioreactor Data Analysis 1.0

0524315 - ÚVGZ 2021 RIV CZ eng L4 - Software
Červený, Jan
Web Tool for Photobioreactor Data Analysis 1.0.
Internal code: DoAB_PBR-DataAnalysis ; 2020
Technical parameters: Programatická realizace pokročilé analýzy vědeckých dat generovaných mikrořasovými kultivártory. K realizaci nástroje byl využit statistický programovací jazyk R a jeho nadstavba pro tvorbu interaktivních webových nástrojů Shiny. Zdrojová data pro analýzu jsou primárně očekávána ve výstupním standardu přístrojů firmy Photon Systems Instruments, s. r. o. Dále jsou podporovány vstupy v tabulkových formátech .csv a .xlsx.
Economic parameters: Využitím tohoto nástroje je dosaženo v průměru 70% zkrácení procesu zpracování a analýzy dat generovaných výkonnými mikrořasovými kultivátory. Automatizace analýzy a použitých přístupů dále spolu s gereováním standardizovaných výstupů zajišťuje efektivnější reporting a přípravu dat pro další stupeň analýzy dat, což vede v průměru k 80% zkrácení časových nároků na analýzu kultivačních dat. K dnešnímu dni bylo celosvětově prodáno více než 500 zařízení, na jejich datové výstupy lze nástroj použít.
R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TN01000048
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : photobioreactor * microalgae * characterization * phenotypization * biotechnology * data science * algorithms * tidy data
OECD category: Plant sciences, botany
https://czechglobe-doab.shinyapps.io/PBR-DataAnalysis/

Interactive web application for advanced processing and analysis of data generated during microalgae culturing in photobioreactors that features several statistical routines for fast and reproducible scientific data evaluation and reporting. This tool was developed to simplify manipulation with untidy data generated by Photon Systems Instruments (PSI) photobioreactor software. The tool accepts source data files from following instruments: Photobioreactors FMT-150 a Multicultivators MC-1000 produced by Photon Systems Instruments company.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0308681