Odhadování syntetické dostupnosti při počítačovém návrhu léčiv

0502627 - ÚMG 2019 RIV CZ cze J - Journal Article
Voršilák, Milan - Svozil, Daniel
Odhadování syntetické dostupnosti při počítačovém návrhu léčiv.
[Estimation of Synthetic Accessibility during Computational Drug Design.]
Chemické listy. Roč. 111, č. 11 (2017), s. 760-765. ISSN 0009-2770. E-ISSN 1213-7103
R&D Projects: GA MŠMT LO1220
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : chemical space, ,,, , * synthetic feasibility * retrosynthetic analysis * molecular complexity * virtual screening * computational drug design
OECD category: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impact factor: 0.260, year: 2017

Virtuální screening umožňuje navrhovat a následně testovat až miliony struktur. Na druhou stranu, ne každá virtuální struktura může být snadno připravena a testována ve skutečnosti. Proto je nutné vyloučit nevhodné kandidáty, ideálně na začátku virtuální screeningové kampaně. K filtraci synteticky neuskutečnitelných struktur se používají tři hlavní přístupy: podobnost s výchozím materiálem, retrosyntetická cesta a složitost struktury. Tyto techniky se liší ve výpočetních nárocích, proto mohou být použity v různých stupních screeningu a / nebo kombinovány pro zlepšení odhadu syntetické proveditelnosti.

Virtual screening makes it possible to design and then test up to millions of structures. On the other hand, not every virtual structure can readily be prepared and tested in reality. Therefore, it is necessary to exclude unsuitable candidates, ideally at the beginning of virtual screening campaign. Three main approaches are used to filter out synthetically unfeasible structures: similarity to starting material, retrosynthetic route and complexity of the structure. These techniques vary in computational demands, they can therefore be used in various stages of screening, and/or combined to improve estimation of synthetic feasibility.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0294523