Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce Stenocephalemys albipes

0471487 - ÚBO 2017 CZ cze A - Abstract
Těšíková, Jana - Meheretu, Y. - Čížková, Dagmar - Bryjová, Anna - Bryja, Josef - Goüy de Bellocq, Joëlle
Tigray virus - nově popsaný hantavirus u etiopského hlodavce Stenocephalemys albipes.
Zoologické dny Brno 2017: sborník abstraktů z konference 9.-10. února 2017. Brno: Ústav biologie obratlovců AV ČR, 2017 - (Bryja, J.; Horsák, M.; Horsáková, V.; Řehák, Z.; Zukal, J.). s. 207. ISBN 978-80-87189-21-4.
[Zoologické dny. 09.02.2017-10.02.2017, Brno]
Institutional support: RVO:68081766
Keywords : rodents * hantavirus
Subject RIV: EG - Zoology

Hantaviry jsou obalené jednořetězcové RNA viry patřící do čeledi Bunyaviridae. Jejich přirození hostitelé jsou hlodavci, letouni a hmyzožravci. Někteří zástupci jsou významnými patogeny člověka a způsobují řadu závažných zdravotních problémů.
V průběhu předešlé studie jsme ve tkáních etiopského endemického hlodavce Stenocephalemys albipes detekovali vůbec první východoafrický hantavirus, virus Tigray (TIGV) (Meheretu et al. 2012). Metodou sekvenování nové generace (NGS, next-generation sequencing) jsme získali kompletní genom tohoto viru, který vykazuje typickou organizaci segmentovaného genomu hantavirů. Fylogenetická analýza kódujících částí genomu potvrdila umístění TIGV do skupiny III (sensu Guo et al. 2013), avšak s rozdílnou pozicí pro jednotlivé segmenty. Naším následujícím cílem bylo popsat fylogeografickou strukturu TIGV v Etiopii. Předběžné výsledky, založené na částečné sekvenci L segmentu, ukazují korelaci mezi
prostorovou strukturou TIGV a fylogeografií jeho hostitele. Dalším krokem bude potvrzení tohoto závěru také pro ostatní virové segmenty.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0268869