Srovnání genetické variability imunitních genů a neutrálních markerů mezi plemeny kura domácího

0457502 - ÚBO 2016 cze A - Abstract
Buchtová, L. - Bainová, Z. - Šmídová, A. - Pojezdná, A. - Bryjová, Anna - Bryja, Josef - Munclinger, P. - Vinkler, M.
Srovnání genetické variability imunitních genů a neutrálních markerů mezi plemeny kura domácího.
Zoologické dny České Budějovice 2016: sborník abstraktů z konference 11.-12. února 2016. Brno: Ústav biologie obratlovců AV ČR, 2016 - (Bryja, J.; Sedláček, F.; Fuchs, R.). s. 42. ISBN 978-80-87189-20-7.
[Zoologické dny. 11.02.2016-12.02.2016, České Budějovice]
Institutional support: RVO:68081766
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology

Kur domácí je nejen ekonomicky významným druhem, ale také cenným modelem v evolučně genetickém výzkumu. I přes existenci velkého množství archaických plemen se většina současných studií velice úzce zaměřuje zejména na laboratorní inbrední linie, moderní vysokoprodukční plemena anebo na volně žijící druhy rodu Gallus. Zájmová plemena jsou tak odsouvána do pozadí a zůstávají opomíjena i přesto, že by mohla mít pro další výzkum značný význam. Na vybraném vzorku 110 jedinců reprezentujících 25 starobylých zájmových plemen jsme se pokusili porovnat míru variability vybraných imunitních genů (TLR3, TLR4, TLR5, TLR7) a neutrálních markerů (kontrolního regionu mtDNA a 19 mikrosatelitových lokusů). Cílem bylo také zjistit, jak moc se od sebe jednotlivá plemena liší a zda je míra této genetické odlišnosti odvoditelná z předpokládaného původu plemen. Všechna studovaná plemena náležela ke čtyřem mitochondriálním haplotypovým rodinám, z nichž nejběžnější byla rodina E1. Některá plemena (např. Japonky, Brahmánky nebo Rousné zakrslé) nesly více mitochondriálních haplotypů. Genetická variabilita imunitních genů a mikrosatelitů byla vysoká. Analýza ukázala, že je tato variabilita překvapivě vyšší uvnitř starobylých plemen než mezi nimi, což je výsledek kontrastující se situací u vysokoprodukčních komerčních plemen. Variabilita mezi plemeny byla jen lehce vyšší v neutrálních markerech (32%) než v imunitních genech (27%), což souvisí buďto s podobnou mírou ancestrálního polymorfismu anebo genovým tokem mezi plemeny.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0257899