RACIONÁLNÍ NÁVRH MUTACÍ ZVYŠUJÍCÍ AFINITU VAZBY

0379075 - BTÚ 2013 CZ cze O - Others
Mikulecký, Pavel - Černý, Jiří - Biedermannová, Lada - Petroková, Hana - Kuchař, Milan - Malý, Petr - Vondrášek, Jiří - Šebo, Peter - Schneider, Bohdan
RACIONÁLNÍ NÁVRH MUTACÍ ZVYŠUJÍCÍ AFINITU VAZBY.
[Rational design increased affinity. Case study of Receptor 1 of interferon-γ.]
2012
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50520701
Keywords : interferon-γ * receptor 1 * rational design
Subject RIV: EI - Biotechnology ; Bionics

Počítačová předpověď proteinových mutací vedoucí ke zvýšení jejich afinity k cílovému proteinu není běžně používaný, ale užitečný nástroj proteinového inženýrství. Zde ukazujeme, že dostupnými výpočetními prostředky je možné předpovědět zvýšení afinity receptoru 1 k interferonu-γ. U dvou, ze čtrnácti předpovězených mutant, došlo k pětinásobnému zvýšení disociační rovnovážné konstanty Kd jak bylo ukázáno měřením povrchovou plasmonovou resonancí, SPR.

Computer design of mutations increasing affinity to the target protein is not a standard but useful tool of protein engineering. Here we show that it is possible to apply relatively simple and accessible computer techniques based on empirical potential to predict mutants of receptor 1 to interferon-γ. Two out of fourteen designed mutants showed about five-fold increase of dissociation equilibrium constant Kd as measured by surface plasmon resonance, SPR.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0210353