MULTIDYN, paralelní software pro neadiabatickou molekulární dynamiku

0377091 - ÚGN 2013 RIV CZ cze, eng L4 - Software
Stachoň, M. - Hrivňák, D. - Janeček, Ivan - Kalus, R.
MULTIDYN, paralelní software pro neadiabatickou molekulární dynamiku.
[MULTIDYN, a parallel software for non-adiabatic molecular dynamics.]
Internal code: MULTIDYN 2.0 ; 2011
Technical parameters: René Kalus VŠB-TUO, rene.kalus@vsb.cz
Economic parameters: Software je určen pro numerické simulace smíšených klasických (jaderné stupně volnosti) a kvantových (elektrony) atomových komplexů se zahrnutím velkého počtu elektronových stavů a přechodů mezi nimi.
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0070; GA MŠMT ED2.1.00/03.0082
Institutional research plan: CEZ:AV0Z30860518
Keywords : non-adiabatic molecular dynamics * MPI protocol * interaction models
Subject RIV: JC - Computer Hardware ; Software; JC - Computer Hardware ; Software (UFCH-W)
http://moldyn.vsb.cz/multidyn/

MULTIDYN byl vyvinut na Ostravské univerzitě, Ústavu Geoniky AVČR a VŠB - Technické univerzitě Ostrava s přispěním Ústavu fyzikální chemie Heyrovského AVČR v Praze a Univerzity Sabatiera v Toulouse. Software je určen pro numerické simulace smíšených klasických (jaderné stupně volnosti) a kvantových (elektrony) atomových komplexů se zahrnutím velkého počtu elektronových stavů a přechodů mezi nimi. V současné verzi je v rámci metody kvaziklasických trajektorií implementováno dynamické schéma středního pole (mean-field) se zahrnutím kvantové dekoherence, paralelizováno protokolem MPI. Implementované interakční modely zahrnují jednou ionizované klastry argonu, kryptonu a xenonu a jsou založeny na rozšířené metodě diatomika v molekulách (diatomics-in-molecules) se zahrnutím spinorbitální interakce a významných vícečásticových interakcí. Různé neadiabatické procesy v těchto klastrech mohou být modelovány pomocí kombinace výpočetního jádra (MULTIDIS) s vyvinutými nástroji pro preprocessing. Kód je sestaven v jazyce Fortran 90 a paralelizován pomocí protokolu MPI, využívá knihoven LAPACK a BLAS.

MULTIDYN has been developed at the University of Ostrava, the Institute of Geonics of the Academy of Sciences of the CR, and the VSB - Technical University of Ostrava in a close collaboration with the Heyrovsky Institute of Physical Chemistry, Prague, CR, and P. Sabatier University, Toulouse, FR. The package has been designed for numerical simulations of mixed classical nuclear and quantum electronic dynamics of atomic complexes with many electronic states and trasitions between them involved. In the present version, several mean-field dynamical schemes with the inclusion of quantum decoherence have been implemented for the (semi)classical trajectory approach and parallelized over the trajectories using the MPI protocol. Presently implemented interaction models comprise cationic clusters of argon, krypton and xenon, and are based on extended semiempirical diatomics-in-molecules approaches with the inclusion of the spin-orbit coupling and leading many-body interaction terms. The code is written in Fortran 90 and has been pararellized using MPI. It also requires LAPACK and BLAS libraries.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0209344