Probing filamentarity of nuclear skeletal structures by methods of spatial statistics, mathematical morphology and image analysis

0337723 - FGÚ 2010 RIV AT eng C - Conference Paper (international conference)
Vyhnal, Aleš - Philimonenko, Anatoly - Hozák, Pavel - Kubínová, Lucie
Probing filamentarity of nuclear skeletal structures by methods of spatial statistics, mathematical morphology and image analysis.
[Zkoumání filamentarity jaderných skeletálních struktur metodami prostorové statistiky, matematické morfologie a obrazové analýzy.]
MC 2009 : Microscopy Conference. Vol.2. Graz: Verlag der Technischen Universität, 2009 - (Pabst, M.; Zellnig, G.), s. 355-356. ISBN 978-3-85125-062-6.
[MC 2009 - Joint Meeting of Dreiländertagung and Multinational Congress on Microscopy /9./. Graz (AT), 30.08.2009-04.09.2009]
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LC06063; GA ČR GD204/09/H084
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50110509; CEZ:AV0Z50520514
Keywords : cell nucleus * spatial statistics * filamentarity
Subject RIV: EA - Cell Biology

The first objective of this study was to apply statistical methods of characterization of filamentarity in point-like patterns. The second objective was to apply mathematical methods of filaments extraction and visualization from these data. We explored and compared the efficiency of various tools for filamentarity quantification and filaments extraction in the case of a specific protein, the filamentarity of which is firmly established, i.e., vimentin, with the view to explore filamentous structures formed by actin in the nucleus

Prvním cílem tohoto příspěvku bylo užití statistických metod charakterizace filamentarity bodových struktur. Druhým cílem pak bylo užití matematických metod extrakce filament z těchto dat a jejich vizualizace. Zkoumali jsme a porovnali efektivitu různých metod kvantifikace stupně filamentarity a extrakce filament v případě proteinu vimentinu, o kterém je dobře známo, že filamenta skutečně tvoří s výhledem ke zkoumání filamentárních struktur tvořených aktinem v buněčném jádře
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0181652