Pšenice – od genomu po rohlík

0330610 - ÚEB 2010 RIV CZ cze M - Monography Chapter
Robert-Quatre, Heda - Valárik, Miroslav - Šimková, Hana
Genetické mapování a poziční klonování u pšenice.
[Genetic mapping and positional gene cloning in wheat.]
Pšenice – od genomu po rohlík. České Budějovice: Kurent, s.r.o, 2008 - (Hosnedl, V.; Doležel, J.; Chloupek, O.; Horčička, P.), s. 30-37. ISBN 978-80-87111-12-3
R&D Projects: GA ČR GD521/05/H013
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50380511
Keywords : wheat * genetic mapping * physical mapping
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology

Genom alohexaploidní pšenice seté (Triticum aestivum L.) je složený ze tří homeologních genomů. Komplikovanost tohoto velkého (17 000 Mbp) a vysoce repetitivního (>80%) genomu po mnoho let bránila pozičnímu klonování. V současnosti, a to díky novým genomickým zdrojům a databázím známých genových sekvencí, již bylo izolováno 10 hospodářsky významných genů pšenice seté. Kapitola přibližuje metody pozičního klonování sloužící k izolaci genů, včetně konstrukce vysoce-hustotních genetických map s využitím DNA markerů a fyzického mapování pomocí BAC klonů. Tento přístup rozvíjí možnosti genomiky pšenice na poli transgenoze vedoucí k detekci hospodářsky významných alel genů za využití selekce za pomocí markerů.

Allohexaploid bread wheat (Triticum aestivum L.) genome consist of three homoelogous genomes. For many years, the complexity of this large (17 000 Mbp) and highly repetitive (>80%) genome hampered positional cloning. Recently, thanks to new genomic resources and databases of known genomic sequences, more than 10 agronomically important bread wheat genes were isolated such as genes of resistence to pathogens, genes of flowering regulation or stress – related genes. Here we report on map – based cloning, including the construction of high – density genetic maps using DNA markers and physical mapping using large BAC clones to isolate a gene of interest. This method opens perspectives for improvement of bread wheat through transgenosis and provides possibilities to detect agronomically favourable alleles by marker – assisted selection (MAS).
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0176360