1H, 13C, and 15N resonance assignment of the N-terminal domainof Mason-Pfizer monkey virus capsid protein, CA 1-140

0320828 - MBÚ 2009 RIV DE eng J - Journal Article
Macek, Pavel - Žídek, L. - Rumlová, Michaela - Pichová, Iva - Sklenář, V.
1H, 13C, and 15N resonance assignment of the N-terminal domainof Mason-Pfizer monkey virus capsid protein, CA 1-140.
[Přiřazení 1H, 13C a 15N rezonancí N-terminální domény kapsidového proteinu Mason-Pfizer opičího viru.]
Biomolecular NMR Assignments. Roč. 2, č. 1 (2008), s. 43-45. ISSN 1874-2718. E-ISSN 1874-270X
R&D Projects: GA MŠMT LC545; GA MŠMT(CZ) LC06030; GA MŠMT 1M0508
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50200510; CEZ:AV0Z40550506
Keywords : nmr * assignment * capsid protein
Subject RIV: EE - Microbiology, Virology
Impact factor: 0.015, year: 2008

Mason-Pfizer monkey virus (M-PMV) belongs to the family of betaretroviruses characterized by the assembly of immature particles within cytoplasm of infected cells in contrast to other retroviruses (e.g. HIV, RSV) that assemble their immature particles at a plasma membrane. Simultaneously with or shortly after budding a virus-encoded protease is activated and the Gag polyprotein is cleaved into three major structural proteins: matrix (MA), capsid (CA), and nucleocapsid (NC) protein. Mature retroviral CA proteins consist of two independently folded structural domains: N-terminal domain (NTD) and C-terminal dimerization domain (CTD), separated by a flexible linker. As a first step toward the solution structure elucidation, we present nearly complete backbone and sidechain 1H, 15N and 13C resonance assignment of the M-PMV NTD Ca

Mason-Pfizer opičí nirus (M-PMV) patří do skupiny betaretrovirů charakterizovaných skládáním nezralé partikule v cytoplasmě infikované buňky na rozdíl od jiných betaretrovirů (např. HIV, RSV), jejichž nezralé partikule se skládaji na plasmatické membráně. Zároveň, nebo krátce po vypučení se aktivuje virová proteáza a Gag polyprotein je rozštěpen na tři základní strukturní proteiny: matrixový (MA), kapsidový (CA) a nukleokapsidový (NC). Zralý retrovirový CA protein se skládá ze dvou nezávislých strukturních domén: N-terminální (NTD) a C-terminální (CTD) vzájemně propojených ohebnou smyčkou. Jako první krok k vyřešení struktury je předloženo téměř komletní přiřazení 1H, 15N a 13C rezonancí páteře a bočních řetězců M-PMV NTD CA
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0169583