Basic phylogenetic methods

0320184 - ÚBO 2009 RIV CZ eng C - Conference Paper (international conference)
Vallo, Peter
Basic phylogenetic methods.
[Základní fylogenetické metody.]
Proceedings of the 4th International Summer School on Computational Biology. Brno: Masaryk University, 2008 - (Dušek, L.; Haruštiaková, D.; Martínková, N.), s. 72-82. ISBN 978-80-210-4793-8.
[International Summer School on Computational Biology /4./. Brno (CZ), 29.05.2008-31.05.2008]
Institutional research plan: CEZ:AV0Z60930519
Keywords : molecular phylogeny * distance methods * maximum parsimony * maximum likelihood * Bayesian analysis
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology

This volume comprises contributions of a team of lecturers, who held their speeches at a course for undergraduate students on computational biology. The particular topic of phylogenetic methods is briefly introduced, covering basics of DNA sequence evolution and tree nomenclature. Methods of tree reconstructions are further explained; both general tree searching algorithms and particular reconstruction methods i.e. distance, parsimony, likelihood and Bayesian approaches.

Tento svazek zahrnuje příspěvky týmu autorů, kteří přednášeli na kurzu výpočetní biologie pro pregraduální studenty. Téma fylogenetických metod je stručne uvedeno, pokrývajíc základy evoluce sekvencí DNA a názvosloví stromů. Dále jsou vysvětlovány metody rekonstrukce stromů; jak obecné algoritmy pro hledání stromů, tak i jednotlivé metody rekonstrukce t.j. distanční, parsimonický, věrohodnostní a Bayesiánský přístup.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0169130