Measurement of surface area of biological structures, based on 3D microscopic image data

0314647 - FGÚ 2009 RIV DE eng C - Conference Paper (international conference)
Kubínová, Lucie - Janáček, Jiří
Measurement of surface area of biological structures, based on 3D microscopic image data.
[Měření povrchu biologických struktur, založené na trojrozměrných mikroskopických obrazových datech.]
EMC 2008. Vol. 1. Berlin: Springer, 2008 - (Luysberg, M.; Tillman, K.; Weirich, T.), s. 785-786. ISBN 978-3-540-85154-7.
[European Microscopy Congress EMC 2008 /14./. Aachen (DE), 01.09.2008-05.09.2008]
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LC06063; GA AV ČR(CZ) IAA600110507; GA AV ČR(CZ) IAA100110502; GA AV ČR(CZ) IAA500200510
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50110509
Keywords : surface area * stereology * confocal microscopy
Subject RIV: EA - Cell Biology

We developed software implementation of a number of methods for surface area estimation based on evaluation of 3D image data, namely interactive stereological methods and automatic or semi-automatic digital methods. The methods for surface area measurement were demonstrated on 3D images acquired by confocal microscopy or electron tomography techniques. We compared the above stereological and image analysis methods for surface area estimation from the point of view of their applicability, efficiency and precision

Vyvinuli jsme softwarové implementace řady metod pro odhad povrchu, založených na hodnocení trojrozměrných obrazových dat, konkrétně interaktivních stereologických metod a automatických či poloautomatických digitálních metod. Metody pro měření povrchu byly demonstrovány na trojrozměrných obrazech získaných konfokální mikroskopií či elektronovou tomografií. Výše zmíněné stereologické metody a metody analýzy obrazu pro odhad povrchu jsme porovnali z hlediska jejich použitelnosti, účinnosti a přesnosti
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0165091