Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of mouse galectin-4 N-terminal carbohydrate recognition domain in complex with lactose

0312444 - ÚMG 2009 RIV GB eng J - Journal Article
Krejčiříková, Veronika - Fábry, Milan - Marková, Vladimíra - Malý, Petr - Řezáčová, Pavlína - Brynda, Jiří
Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of mouse galectin-4 N-terminal carbohydrate recognition domain in complex with lactose.
[Krystalizace a předběžná rentgenostrukturní analýza komplexu N-koncové CRD domény myšího galektinu-4 s laktosou.]
Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications. Roč. 64, č. 7 (2008), s. 665-667. ISSN 1744-3091. E-ISSN 2053-230X
R&D Projects: GA ČR GA304/03/0090
Institutional research plan: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50520514
Keywords : 3-D structure * sugar binding * tumour marker
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 0.606, year: 2008

Galectin-4 is thought to play a role in the process of tumour conversion of cells of the alimentary tract and the breast tissue; however, its exact function remains unknown. With the aim of elucidating the structural basis of mouse galectin-4 (mGal-4) binding specificity, we have undertaken X-ray analysis of the N-terminal domain, CRD1, of mGal-4 in complex with lactose (the basic building block of known galectin-4 carbohydrate ligands). An optimized crystallization procedure and cryocooling protocol allowed us to extend resolution to 2.1 A. Structure refinement is currently under way; the initial electron-density maps clearly show non-protein electron density in the vicinity of the carbohydrate binding site, indicating the presence of one lactose molecule. The structure will help to improve understanding of the binding specificity and function of the potential colon cancer marker galectin-4.

Galektin-4 zřejmě hraje roli v nádorové konverzi buněk trávicího traktu, jeho přesná funkce však dosud není známa. Cílem práce bylo přispět k objasnění strukturního základu vazebné specifity myšího galektinu-4 pomocí rentgenostrukturní analýzy N-koncové, cukr rozpoznávající domény CRD1, v komplexu s laktosou. Struktura přispěje k pochopení vazebné specifity a funkce galektinu-4, potenciálního markeru nádorů tlustého střeva.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0163509