0102819 - UMBR-M 20043035 RIV NL eng J - Journal Article
Neumann, Pavel - Požárková, Dana - Macas, Jiří
Highly abundant pea LTR retrotransposon Ogre is constitutively transcribed and partially spliced.
[LTR-retrotransposon Ogre z genomu hrachu je konstitutivně transkribován a částečně sestřiháván.]
Plant Molecular Biology. Roč. 53, - (2003), s. 399-410. ISSN 0167-4412. E-ISSN 1573-5028
R&D Projects: GA ČR GA521/00/0655; GA ČR GP521/02/P007
Keywords : plant genome
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 3.795, year: 2003

We have isolated and characterized a novel giant retroelement, named Ogre, which is over 22 kb long and makes up at least 5% of the pea :Pisum sativum L. genome. This element can be classified as a Ty3/gypsy-like LTR retrotransposon based on the presence of long terminal repeats :LTRs and the order of the domains coding for typical retrotransposon proteins.

Práce popisuje izolaci a charakterizaci nového gigantického retroelementu, pojmenovaného Ogre, který je dlouhý přes 22 kb a jehož sekvence tvoří nejméně 5% genomu hrachu (Pisum sativum). Jde o LTR-retrotransposon typu Ty3/gypsy, který vykazuje několik neobvyklých strukturních rysů, jakými jsou např. extrémně dlouhé LTRs, přítomnost nadbytečného ORF a intronu, který je z části transkriptů sestřihován.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0010156