Detection of Anaplasma DNA in Ixodes ricinus ticks: pitfalls

0096326 - ÚBO 2008 RIV CZ eng J - Journal Article
Šikutová, Silvie - Rudolf, Ivo - Golovchenko, Maryna - Rudenko, Natalia - Grubhoffer, Libor - Hubálek, Zdeněk
Detection of Anaplasma DNA in Ixodes ricinus ticks: pitfalls.
[Detekce DNA Anaplasma v klíšťatech Ixodes ricinus: nástrahy.]
Folia Parasitologica. Roč. 54, č. 4 (2007), s. 310-312. ISSN 0015-5683. E-ISSN 1803-6465
R&D Projects: GA ČR GA206/03/0726; GA ČR(CZ) GA524/06/1479; GA AV ČR KJB600930613; GA MŠMT(CZ) LC06009
EU Projects: European Commission(XE) 10284 - EDEN
Institutional research plan: CEZ:AV0Z60930519; CEZ:AV0Z60220518
Source of funding: R - Framework programmes of European Commission
Keywords : PCR detection * Ehrlichia * primer specificity
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 1.000, year: 2007
http://folia.paru.cas.cz/pdfs/showpdf.php?pdf=20863

A total of 150 nymphal Ixodes ricinus (L., 1758) (Acari: Ixodidae) from the Czech Republic were examined for Anaplasma phagocytophilum (Foggie, 1949) Dumler et al., 2001 by PCR using EHR521/747 primers: 22 of 50 pools were positive (minimum prevalence, 14.7%). However, sequencing of the PCR products did not show complete homology with A. phagocytophilum (91%) while the closest relationship (95%) was found to Candidatus Ehrlichia walkerii. The results indicate a need for care in interpretation of Anaplasma PCR results and for PCR optimization for detecting A. phagocytophilum in ticks.

Metodou PCR za použití primerů EHR521/747 bylo vyšetřeno na přítomnost Anaplasma phagocytophilum (Foggie, 1949) Dumler et al., 2001 v České republice 150 nymf klíšťat Ixodes ricinus (L., 1758) (Acarina: Ixodidae): 22 z 50 vyšetřených poolů bylo pozitivních (minimální prevalence 14,7 %). Naproti tomu však sekvenace PCR produktů neukázala úplnou shodu s A. phagocytophilum (91 %), nejvyšší nukleotidová shoda byla zjištěna s "Candidatus Ehrlichia walkerii" (95 %). Výsledky naznačují potřebu vysoké obezřetnosti a opatrnosti při prezentaci PCR výsledků a nutnost optimalizace PCR metody pro detekci A. phagocytophilum v klíšťatech.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0155720