The multilocus phylogenetic study: incogruence between mitochondrial and nuclear markers in Neotropical cichlid fish

0094225 - ÚŽFG 2008 RIV SE eng C - Conference Paper (international conference)
Musilová, Zuzana - Janko, Karel - Novák, J. - Říčan, Oldřich
The multilocus phylogenetic study: incogruence between mitochondrial and nuclear markers in Neotropical cichlid fish.
[Multilokusová fylogenetická studie: nesoulad mezi mitochondriálními a jadernými markery u Neotropických cichlid.]
XI. Congress of European Society for Evolutionary Biology. Uppsala: University of Uppsala, 2007, s. 1-1.
[Congress of European Society for Evolutionary Biology /11./. Uppsala (SE), 20.08.2007-25.08.2007]
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50450515
Keywords : Neotropical cichlid fish
Subject RIV: EG - Zoology

The phylogenetic analysis was performed on Neotropical cichlids of the tribe Cichlasomatini. Four molecular markers were used, both nuclear (S7 intron, RAG1) and mitochondrial (cytochrome b, 16S rRNA). We found important disagreements between the traditional morphological classification and the phylogeny based on our molecular data. We tried to differentiate the incongruence caused by selected marker from the sampling or method bias. Incongruence in the results occurred mainly in the deeper topology of phylogenetic.

Byla provedena fylogenetická studie Neotropických cichlid tribu Cichlasomatini. Použili jsme čtyři molekulární markery, jaderné (intron v S7 a RAG1 gen) i mitochondriální (gen pro cytochrom b a 16S rRNA). Nalezli jsme rozpor mezi tradiční morfologickou analýzou a fylogenetikou založenou na našich molekulárních datech. Pokusili jsme se odlišit inkongruence způsobené vybranými markery od odlišností zaviněné nevhodným vzorkováním nebo metodou. Inkongruence se vyskytly hlavně v hlubší topologii stromů.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0154079