Tryptophan biosynthesis in stramenopiles: eukaryotic winners in the diatom complex chloroplast

0089659 - BC 2008 RIV US eng J - Journal Article
Jiroutová, Kateřina - Horák, Aleš - Bowler, C. - Oborník, Miroslav
Tryptophan biosynthesis in stramenopiles: eukaryotic winners in the diatom complex chloroplast.
[Syntéza tryptofanu u stramenopil: eukaryotičtí vítězové v komplexním plastidu rozsivek.]
Journal of Molecular Evolution. Roč. 65, č. 5 (2007), s. 496-511. ISSN 0022-2844. E-ISSN 1432-1432
R&D Projects: GA AV ČR IAA500220502
Institutional research plan: CEZ:AV0Z60220518
Keywords : tryptophan synthesis * mosaic origin * diatom * Oomycetes
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 3.234, year: 2007

In silico analysis of the tryptophan biosynthetic pathway in stramenopiles as inferred from the completely sequenced nuclear genomes of oomycetes Phytophthora sojae and P. ramorum, and diatoms Thalassiosira pseudonana, Phaeodactylum tricornutum. It shows that only a single enzyme (InGPS) of the pathway display expected cyanobacterial origin, while all the other enyzmes involved originate from eukaryotic nucleus, however, they are targeted to the diatom complex chloroplast.

In silico analýza dráhy pro syntézu tryptofanu u stramenopil byla odvozena z kompletně osekvenovaných genomů oomycét Phytophthora sojae a P. ramorum a z rozsivek Thalassiosira pseudonana a Phaeodactylum tricornutum. Analýza ukázala, že pouze jediný enzym této dráhy (InGPS) pravděpodobně pochází z cyanobakterie tak, jak bylo očekáváno u enzymů cílených do chloroplastu. Všechny ostatní zúčastněné enzymy pocházejí z eukaryotického jádra, jsou však cíleny do komplexního chloroplastu rozsivek.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0150802