Vizualization of large biological tissue specimens using confocal laser scanning microscopy

0050747 - FGÚ 2007 RIV CZ eng K - Conference Paper (Czech conference)
Čapek, Martin - Kubínová, Lucie - Hána, K. - Smrčka, P.
Vizualization of large biological tissue specimens using confocal laser scanning microscopy.
[Vizualizace velkých biologických tkáňových vzorků s použitím laserové konfokální mikroskopie.]
Proceedings of Workshop 2006. Praha: Czech Technical University, 2006 - (Říha, B.), s. 552-553. CTU reports, vol. 10. ISBN 80-01-03439-9.
[Annual university-wide seminar WORKSHOP 2006 /13./. Prague (CZ), 20.02.2006-24.02.2006]
R&D Projects: GA AV ČR(CZ) IAA100110502; GA AV ČR(CZ) KJB6011309; GA AV ČR(CZ) IAA600110507
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50110509
Keywords : confocal microscopy * volume reconstruction * volume visualization
Subject RIV: JC - Computer Hardware ; Software

In biology there is often necessary to visualize a biological specimen which size is greater when compared with the field of view of a used optical acquisition instrument. The visualization of such the specimen can be achieved by volume reconstruction. We study biological specimens by using a confocal laser scanning microscope which is able to capture a digital volume representation of the specimen. We investigate great specimens containing, for example, a human tooth pulp, an epithelial layer and a vascular bed of chick embryonic gut or chick embryonic kidneys

Objemová rekonstrukce je metoda sloužící k vizualizaci trojrozměrné struktury biologických vzorků, jejichž velikost může být větší než je horizontální či axiální zorné pole snímacího systému (v našem případě laserového konfokálního mikroskopu). Velké vzorky je nutné nařezat na tenké fyzické řezy. Pak se snímají všechny sousedící a překrývající se objemové obrazy v rámci jednotlivých fyzických řezů (kompenzace omezeného horizontálního zorného pole). Takové sousedící obrazy se dále získají pro všechny sériové fyzické řezy (kompenzace omezeného axiálního zorného pole)
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0140812