Repetitive sequence divergence in Nicotiana

0039179 - BFÚ 2007 FR eng A - Abstract
Leitch, A.R. - Lim, K.Y. - Matyášek, Roman - Fulneček, Jaroslav - Chase, M.W. - Knapp, S. - Clarkson, J.J. - Kovařík, Aleš
Repetitive sequence divergence in Nicotiana.
[Divergence repetitivních sekvencí u Nicotiana.]
Abstract. Bordeaux, 2006.
[Groupe Cytogenetique et polyploidie. 05.04.2006-07.04.2006, Bordeaux]
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50040507
Keywords : allopolyploidy * evolution of genome * satellite repeats
Subject RIV: BO - Biophysics

In this work we have studied the fate of satellite sequences inherited from progenitor genomes in several Nicotiana allopolyploid species. In Nicotiana tabacum supposed to be several tens of thousands years old allotetraploid the parental satellites remain largely unchanged except for one intergenomic translocation. In Repanda section, the allotetraploids are supposed to be about 5 million years. In this section the parental satellites were only barely detectable while new satellites have evolved. The data indicate that there is a near wholesale replacement of the vast majority of DNA in these plant genomes in less than 5 million years.

V této práci jsme u několika alopolyploidních druhů rodu Nicotiana studovali vývoj satelitních sekvencí DNA, které byly zděděny od rodičů. V N. tabacum (tabák), jehož stáří se odhaduje na několik desítek tisíc let, zůstávají rodičovské satelitní sekvence s výjimkou jedné translokace prakticky nezměněny. Naproti tomu v sekci Rapanda, která zahrnuje allopolyploidní druhy staré několik milionů let, jsme pozorovali vymizení rodičovských sekvencí DNA a vývoj nových druhově specifických satelitů. Tyto údaje svědčí o tom, že většina DNA se u rostlin vymění během relativně krátké doby odpovídající přibližně 5 miliónům roků.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0133338