Využitie neinvazívnej genetickej metódy pre výskum vydry riečnej (Lutra lutra)

0027448 - ÚBO 2006 RIV SK slo C - Conference Paper (international conference)
Hájková, Petra - Hájek, B. - Bryja, Josef - Zemanová, Barbora - Zima, Jan
Využitie neinvazívnej genetickej metódy pre výskum vydry riečnej (Lutra lutra).
[The use of non-invasive genetic method for studying Eurasian otters (Lutra lutra).]
Výskum a ochrana cicavcov na Slovensku 6. Banská Bystrica: Štátna ochrana prírody, Centrum ochrany prírody a krajiny, 2004 - (Adamec, M.; Urban, P.), s. 157-165. ISBN 80-89035-31-0.
[Výskum a ochrana cicavcov na Slovensku /6./. Zvolen (SK), 10.10.2003-11.10.2003]
R&D Projects: GA ČR GA206/03/0757
Institutional research plan: CEZ:AV0Z6093917
Keywords : Lutra lutra * DNA typing
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology

Genetické analýzy trusu s využitím mikrosatelitových a Sry markerov môžu umožniť identifikáciu jedincov, ich pohlavia a príbuznosti i stanovenie početnosti a genetickej variability skúmanej populácie, a to bez priameho kontaktu a vyrušovania živočícha. Cieľom nášho projektu je stanoviť početnosť a štruktúru populácie vydry riečnej v dvoch rôznych biotopoch v Čechách a na Slovensku neinvazívnou genetickou metódou. V prvej fáze projektu boli analyzované dostupné vzorky tkanív z uhynutých jedincov. Priemerná pozorovaná heterozygotnosť na 5 polymorfných mikrosatelitových lokusoch bola 0,596 a priemerný počet alel na lokus 4,0 u vydier z ČR (n = 23) a 0,657 resp. 3,2 u vydier zo SR (n = 7). Metóda bola následne testovaná na čerstvom truse vydier chovaných v zajatí i na vzorkách z voľne žijúcej populácie. Doteraz bolo identifikovaných 8 rôznych genotypov (jedincov) na území 35 km vodných tokov v horskej oblasti NP Slovenský raj.

Genetic analysis of faeces using microsatellite and Sry markers can provide identification of individuals, sex, relatedness, estimates of population size and the level of genetic polymorphism, all without direct contact with the animal. The aim of our project is to assess otter population size and structure in two different habitats in the Czech and Slovak Republics through non-invasive genetic analysis. In the first phase of the project, tissue samples from otter carcasses were analysed. The mean observed heterozygosity on 5 polymorphic microsatellite loci was 0.596 and average number of alleles per locus 4.0 for otters from Czech Republic (n = 23), and 0.657 and 3.2 respectively for otters from Slovakia (n = 7). The methodology was subsequently tested on very fresh spraints from both captive and wild otters. To date, 8 different otter genotypes (individuals) have been identified from a 35 km watercourse in the mountainous area of the Slovenský raj National Park.

Genetické analýzy trusu s využitím mikrosatelitních a Sry markerů mohou umožnit identifikaci jedinců, jejich pohlaví a příbuznosti i stanovení početnosti a genetické variability zkoumané populace, a to bez přímého kontaktu a vyrušování živočicha. Cílem našeho projektu je stanovit početnost a strukturu populace vydry říční ve dvou různých biotopech v Čechách a na Slovensku neinvazivní genetickou metodou. V první fázi projektu byly analyzovány dostupné vzorky tkání z uhynulých jedinců. Průměrná pozorovaná heterozygotnost na pěti polymorfních mikrosatelitních lokusech byla 0,596 a průměrný počet alel na lokus 4,0 u vyder z ČR (n = 23) a 0,657 resp. 3,2 u vyder ze SR (n = 7). Metoda byla následně testována na čerstvém trusu vyder chovaných v zajetí i na vzorcích z volně žijící populace. Doposud bylo identifikováno 8 různých genotypů (jedinců) na území 35 km vodních toků v horské oblasti NP Slovenský ráj.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0117549