Substrate evokes translocation of both domains in the mitochondrial processing peptidase alfa-subunit during which the C-terminus acts as a stabilizing element

0022937 - MBÚ 2006 RIV SIGLE US eng J - Journal Article
Janata, Jiří - Holá, Klára - Kubala, Martin - Gakh, A. - Parkhomenko, Natalia - Matušková, Anna - Kutejová, E. - Amler, Evžen
Substrate evokes translocation of both domains in the mitochondrial processing peptidase alfa-subunit during which the C-terminus acts as a stabilizing element.
[Substrát vyvolává translokaci obou domén alfa-podjednotky mitochondriální procesující peptidasy, při níž působí její C-konec jako stabilizační prvek.]
Biochemical and Biophysical Research Communications. Roč. 316, - (2004), s. 211-217. ISSN 0006-291X. E-ISSN 1090-2104
R&D Projects: GA ČR GA204/01/1001
Institutional research plan: CEZ:AV0Z5020903
Keywords : metallopeptidase * mitochondria * mitochondrial processing peptidase
Subject RIV: EE - Microbiology, Virology
Impact factor: 2.904, year: 2004

All three tryptophan residues in alfa-subunit of mitochondrial processing peptidase (MPP) were subsequently substituted. While substitutions of Trp223 led to misfolded non-functional protein, mutations of Trp147 and/or Trp481 did not affect the enzyme processing activity. Thus, fluorescence properties of the mutants with fewer tryptophans were used for observation of both a-MPP domain translocation and visualization of conformational changes in the interdomain linker evoked by substrate. We found that in the presence of substrate the C-terminal penultimate Trp481 was approaching Trp223, which is localized at the border of N-terminal domain and interdomain linker. Also, excision of the a-MPP C-terminal 30 amino acid residues (DC30) led to a complete loss of protein function

Všechny tři tryptofanové zbytky v alfa podjednotce mitochondriální procesující peptidasy byly postupně nahrazeny a bylo zjištěno, že zachování zbytku Trp223 je pro funkci a správné složení nezbytný. Další dvě substituce neovlivnily vlastnosti enzymu. Pozměněné proteiny s omezeným počtem tryptofanů byly využity pro pozorování konfirmačních změn obou domén podjednotky při interakci se substrátem. V přítomnosti substrátu dochází v významnému přiblížení zbytků Trp481 a Trp223, které jsou součástí různých domén proteinu
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0111630