Integrated transcriptional profiling and linkage analysis for identification of genes underlying disease

0001012 - FGÚ 2006 RIV US eng J - Journal Article
Hubner, N. - Wallace, C.A. - Zimdahl, H. - Petretto, E. - Schulz, H. - Maciver, F. - Mueller, M. - Hummel, O. - Monti, J. - Zídek, Václav - Musilová, Alena - Křen, Vladimír - Causton, H. - Game, L. - Born, G. - Schmidt, S. - Müller, A. - Cook, S.A. - Kurtz, T. W. - Whittaker, J. - Pravenec, Michal - Aitman, T. J.
Integrated transcriptional profiling and linkage analysis for identification of genes underlying disease.
[Integrace analýzy profilů genové exprese s vazebnými analýzami pro identifikaci genů odpovědných za choroby.]
Nature Genetics. Roč. 37, č. 3 (2005), s. 243-253. ISSN 1061-4036. E-ISSN 1546-1718
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA301/03/0751; GA ČR(CZ) GA301/04/0390
Grant - others:HHMI(US) 55000331; FIRCA(US) TW01236; Wellcome Trust(GB) GR069065MF
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50110509
Keywords : genetical genomics * RI strains * spontaneously hypertensive rats
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 25.797, year: 2005

Using a novel approach we have launched a search for possible susceptibility genes which predispose individuals to the metabolic syndrome. We combined two different analysis techniques, the DNA chip technique (microarray) and linkage analysis, to identify genes which may contribute to the pathogenesis of the metabolic syndrome. With the aid of the DNA chips, we identified which genes are transcribed or expressed in order to produce proteins. Linkage analysis then allowed to establish a relationship between particular traits, such as hypertension, and particular genes

Primární genetické příčiny podmiňující metabolický syndrom u kmene SHR byly odhaleny pomocí nového přístupu, kombinace analýzy profilů genové exprese na DNA biočipech s vazebnými analýzami u rekombinantních inbredních kmenů vytvořených z kmenů SHR a Brown Norway: (1) s pomocí DNA biočipů byla stanovena kvantitativní exprese téměř 16 000 genů v ledvině a v tuku a (2) vazebné analýzy pak umožnily nalézt vztahy mezi profily genové exprese, geny regulujícími tuto expresi a patofyziologickými znaky metabolického syndromu
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0018207