Výsledky vyhledávání
- 1.0583913 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ngugi, D.K. - Salcher, Michaela M. - Andrei, A.S. - Ghai, Rohit - Klotz, F. - Chiriac, Maria-Cecilia - Ionescu, D. - Buesing, P. - Grossart, H.P. - Xing, P. - Priscu, J. C. - Alymkulov, S. - Pester, M.
Postglacial adaptations enabled colonization and quasi-clonal dispersal of ammonia-oxidizing archaea in modern European large lakes.
Science Advances. Roč. 9, č. 5 (2023), č. článku eadc9392. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * phylogenetic reconstruction * sulfolobus
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 13.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1126/sciadv.adc9392
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351891 - 2.0581040 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kopecký, J. - Kameník, Zdeněk - Omelka, M. - Novotná, J. - Stefani, Tommaso - Sagová-Marečková, M.
Phylogenetically related soil actinomycetes distinguish isolation sites by their metabolic activities.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 99, č. 12 (2023), č. článku fiad139. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant ostatní: AV ČR(CZ) LQ200202002
Program: Prémie Lumina quaeruntur
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: multiple sequence alignment * mass-spectrometry * spatial variation * natural-products * gene-transfer * streptomyces * diversity * bacterial * resistance * coevolution * antibiotic * metabolic differentiation * micro-niche * organic matter * phylogenetic differentiation * soil pH * Streptomyces
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/femsec/article/99/12/fiad139/7342452?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349609 - 3.0580491 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lampe, R.H. - Coale, T.H. - Forsch, K.O. - Jabre, L.J. - Kekuewa, S. - Bertrand, E.M. - Horák, Aleš - Oborník, Miroslav - Rabines, A.J. - Rowland, E. - Zheng, H. - Andersson, A. J. - Barbeau, K. A. - Allen, A. E.
Short-term acidification promotes diverse iron acquisition and conservation mechanisms in upwelling-associated phytoplankton.
Nature Communications. Roč. 14, č. 1 (2023), č. článku 7215. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-03224S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: southern-ocean phytoplankton * dissolved organic-matter * sea co2 fluxes * plankton communities * marine diatom * spatiotemporal variability * microcosm experiments * sequence alignment * gene-expression * carbonic-acid
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-023-42949-1
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349265 - 4.0571955 - ÚEB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomaštíková, Eva - Yang, Fen - Mlynárová, L. - Hafidh, Said - Schořová, Š. - Kusová, A. - Pernisová, M. - Přerovská, T. - Klodová, Božena - Honys, David - Fajkus, Jiří - Pečinka, Aleš - Schrumpfová, P.
RUVBL proteins are involved in plant gametophyte development.
Plant Journal. Roč. 114, č. 2 (2023), s. 325-337. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-15841S; GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA ČR(CZ) GA22-00871S; GA ČR(CZ) GA22-29717S; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:68081707
Klíčová slova: MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENT * TELOMERE-BINDING-PROTEIN * ARABIDOPSIS
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 7.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/tpj.16136
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342810Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Tomastikova_PLANT JOURNAL_325.pdf 1 3.6 MB Jiná povolen - 5.0560115 - ÚMG 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Malinka, František - Zareie, Ashkan - Procházka, Jan - Sedláček, Radislav - Novosadová, Vendula
Batch alignment via retention orders for preprocessing large-scale multi-batch LC-MS experiments.
Bioinformatics. Roč. 38, č. 15 (2022), s. 3759-3767. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1460-2059
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018126; GA MŠMT EF16_013/0001789
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: mass spectrometry data * sequence alignment * metabolomics * algorithms
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/38/15/3759/6617343?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334013 - 6.0558631 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Chiriac, Maria-Cecilia - Bulzu, Paul-Adrian - Andrei, A.S. - Okazaki, Y. - Nakano, S. - Haber, Markus - Kavagutti, Vinicius Silva - Layoun, Paul - Ghai, Rohit - Salcher, Michaela M.
Ecogenomics sheds light on diverse lifestyle strategies in freshwater CPR.
Microbiome. Roč. 10, č. 1 (2022), č. článku 84. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * in-situ hybridization * ribosomal-rna * protein secretion * database * genome * identification * bacteria * symbionts * resource * Patescibacteria * cpr * Freshwater lakes * Metagenomics * Genome reduction * Metabolism * Lifestyle * card-fish
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-022-01274-3
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340290 - 7.0558235 - ÚVGZ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Szlachetko, D. L. - Dudek, M. - Naczk, A. - Kolanowska, Marta
Taxonomy and Biogeography of Andinia-Complex (Orchidaceae).
Diversity. Roč. 14, č. 5 (2022), č. článku 372. E-ISSN 1424-2818
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018123
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: pleurothallidinae orchidaceae * phylogenetic analysis * nomenclatural notes * sequence alignment * genus * taxonomy * Pleurothallidinae * phylogeny * biogeography
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 2.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1424-2818/14/5/372
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331966Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Szlachetko-2022-Taxonomy-and-biogeography-of-andini.pdf 7 6.2 MB Vydavatelský postprint povolen - 8.0557870 - MBÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Qian, P. - Gardiner, Alastair T. - Šímová, I. - Naydenova, K. - Croll, T. - Jackson, P. - Nupur, Nupur - Kloz, Miroslav - Čubáková, Petra - Kuzma, Marek - Zeng, Y. - Castro-Hartmann, P. - van Knippenberg, B. - Goldie, K. - Kaftan, David - Hrouzek, Pavel - Hájek, Jan - Agirre, J. - Siebert, C. - Bína, D. - Sader, K. - Stahlberg, H. - Sobotka, Roman - Russo, C. - Polívka, T. - Hunter, C. - Koblížek, Michal
2.4-angstrom structure of the double-ring Gemmatimonas phototrophica photosystem.
Science Advances. Roč. 8, č. 7 (2022), č. článku eabk3139. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378271
Klíčová slova: multiple sequence alignment * light-harvesting complex * rc-lh1 core complex * cryo-em structure * crystal-structure * rhodospirillum-rubrum * antenna complex * purple bacteria * environment * mechanism
Obor OECD: Microbiology; Biophysics (FZU-D)
Impakt faktor: 13.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abk3139
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331715 - 9.0555207 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Turnsek, J. - Brunson, J.K. - Viedma, M. - Deerinck, T.J. - Horák, Aleš - Oborník, Miroslav - Bielinski, V.A. - Allen, A. E.
Proximity proteomics in a marine diatom reveals a putative cell surface-tochloroplast iron trafficking pathway.
eLife. Roč. 10, FEB 16 2021 (2021), č. článku e52770. ISSN 2050-084X. E-ISSN 2050-084X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-03224S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: engineered ascorbate peroxidase * fructose bisphosphate aldolase * phaeodactylum-tricornutum * transferrin receptor * protein-phosphorylation * functional diversity * sequence alignment * fluorescent-probes * living cells * h+-atpase
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 8.713, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://elifesciences.org/articles/52770
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329724 - 10.0555016 - BC 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Skalický, Tomáš - Alves, J.M.P. - Morais, A.C. - Režnarová, J. - Butenko, Anzhelika - Lukeš, Julius - Serrano, M. - Buck, G. - Teixeira, M.M.G. - Camargo, E.P. - Sanders, M. - Cotton, J.A. - Yurchenko, V. - Kostygov, A.Y.
Endosymbiont Capture, a Repeated Process of Endosymbiont Transfer with Replacement in Trypanosomatids Angomonas spp.
Pathogens. Roč. 10, č. 6 (2021), č. článku 702. E-ISSN 2076-0817
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA20-07186S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * candidatus kinetoplastibacterium * genome * host * diversity * evolution * bacterium * model * introgression * mitochondrial * genome * bacterial endosymbionts * Trypanosomatidae * Angomonas
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.531, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2076-0817/10/6/702
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329633