Výsledky vyhledávání
- 1.0576215 - BÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Belyayev, Alexander - Kalendar, R. - Josefiová, Jiřina - Paštová, Ladislava - Habibi, Farzaneh - Mahelka, Václav - Mandák, Bohumil - Krak, Karol
Telomere sequence variability in genotypes from natural plant populations: unusual block-organized double-monomer terminal telomeric arrays.
BMC Genomics. Roč. 24, September (2023), č. článku 572. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR GA20-20286S
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: evolution * Oxford nanopore sequencing * telomere
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12864-023-09657-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0348547 - 2.0575986 - FZÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Alberti, S. - Schmidt, S. - Hageneder, S. - Angelome, P.C. - Soler-lllia, G.J.A.A. - Vana, P. - Dostálek, Jakub - Azzaroni, O. - Knoll, W.
Large-pore mesoporous silica: template design, thin film preparation and biomolecule infiltration.
Materials Chemistry Frontiers. Roč. 7, č. 18 (2023), s. 4142-4151. E-ISSN 2052-1537
Institucionální podpora: RVO:68378271
Klíčová slova: nanopore * infiltration * optical waveguide spectroscopy * protein
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346099Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0575986.pdf 0 1.2 MB CC licence Vydavatelský postprint povolen - 3.0561822 - ÚEB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Navrátilová, Pavla - Toegelová, Helena - Tulpová, Zuzana - Kuo, Y. T. - Stein, N. - Doležel, Jaroslav - Houben, A. - Šimková, Hana - Mascher, M.
Prospects of telomere-to-telomere assembly in barley: Analysis of sequence gaps in the MorexV3 reference genome.
Plant Biotechnology Journal. Roč. 20, č. 7 (2022), s. 1373-1386. ISSN 1467-7644. E-ISSN 1467-7652
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827; GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA ČR(CZ) GA17-17564S; GA ČR(CZ) GC18-14450J
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: CenH3 * Cereba * ChIP-seq * flow cytometry * nanopore * PacBio HiFi reads * ribosomal DNA * satellite * telomeric repeats
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 13.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/pbi.13816
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334316Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2022_Navratilova_Plant Biotechnology Journal_1373.pdf 1 3.9 MB Jiná povolen - 4.0560490 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novosolov, M. - Yahalomi, D. - Chang, E.S. - Fiala, Ivan - Cartwright, P. - Huchon, D.
The Phylogenetic Position of the Enigmatic, Polypodium hydriforme (Cnidaria, Polypodiozoa): Insights from Mitochondrial Genomes.
Genome Biology and Evolution. Roč. 14, č. 8 (2022), č. článku evac112. ISSN 1759-6653. E-ISSN 1759-6653
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-29370S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Cnidaria * Myxozoa * mtDNA * Oxford Nanopore Technologies * Endocnidozoa * tRNA loss
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://dx.doi.org/10.1093/gbe/evac112
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340166 - 5.0556828 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Firrincieli, A. - Grigoriev, B. - Dostálová, Hana - Cappelletti, M.
The Complete Genome Sequence and Structure of the Oleaginous Rhodococcus opacus Strain PD630 Through Nanopore Technology.
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. Roč. 9, FEB 17 (2022), č. článku 810571. ISSN 2296-4185. E-ISSN 2296-4185
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: stress * Rhodococcus opacus PD630 * nanopore sequencing * oleaginous bacteria * complete genome * Rhodococcus genomics * Rhodococcus opacus plasmids * xenobiotic degradation genes * lipid metabolism genes
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fbioe.2021.810571/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331261 - 6.0555017 - ÚMG 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lopez-Echartea, E. - Šuman, J. - Šmrhová, T. - Rídl, Jakub - Pajer, P. - Strejček, M. - Uhlík, O.
Genomic analysis of dibenzofuran-degrading Pseudomonas veronii strain Pvy reveals its biodegradative versatility.
G3-Genes, Genomes, Genetics. Roč. 11, č. 2 (2021), č. článku jkaa030. ISSN 2160-1836. E-ISSN 2160-1836
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR-CZ - 90047
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Pseudomonas veronii strain Pvy * biodegradation * dioxygenase * dibenzofuran * whole-genome sequencing * nanopore technology * denitrification * organic phosphate mineralization * heavy-metal tolerance
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.542, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/g3journal/article/11/2/jkaa030/6029021?login=false
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329634 - 7.0548344 - BC 2022 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
Vondrak, Tihana - Oliveira, Ludmila - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Neumann, Pavel - Macas, Jiří
Complex sequence organization of heterochromatin in the holocentric plant Cuscuta europaea elucidated by the computational analysis of nanopore reads.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 19, Apr 22 (2021), s. 2179-2189. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-24252S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR-CZ II - 90131
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Satellite DNA * Heterochromatin * Oxford Nanopore sequencing * Fluorescence in situ hybridization * Holocentric chromosomes * LINE elements
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 6.155, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021001227?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329092 - 8.0543446 - ÚMG 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gewartowska, O. - Aranaz Novalichez, Goretti - Krawczyk, P.S. - Mroczek, S. - Kusio-Kobialka, M. - Tarkowski, B. - Špoutil, František - Benada, Oldřich - Kofroňová, Olga - Szwedziak, P. - Cysewski, D. - Gruchota, J. - Szpila, M. - Chlebowski, A. - Sedláček, Radislav - Procházka, Jan - Dziembowski, A.
Cytoplasmic polyadenylation by TENT5A is required for proper bone formation.
Cell Reports. Roč. 35, č. 3 (2021), č. článku 109015. ISSN 2211-1247. E-ISSN 2211-1247
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015040; GA MŠMT(CZ) LM2018126; GA MŠMT EF16_013/0001789; GA MŠMT ED2.1.00/19.0395; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA ČR GJ19-19025Y
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:61388971
Klíčová slova: FAM46A * Nanopore * TENT5A * collagen * direct RNA sequencing * osteoblasts * osteogenesis * osteogenesis imperfecta * poly(A) tail * polyadenylation
Obor OECD: Cell biology; Cell biology (MBU-M)
Impakt faktor: 9.995, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(21)00329-6?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124721003296%3Fshowall%3Dtrue
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320651 - 9.0537188 - FZÚ 2021 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Hu, F. - Angelov, Borislav - Li, S. - Li, N. - Lin, X. - Zou, A.
Single-molecule study of peptides with the same amino acid composition but different sequences by using an aerolysin nanopore.
Chembiochem. Roč. 21, č. 17 (2020), s. 2467-2473. ISSN 1439-4227. E-ISSN 1439-7633
Institucionální podpora: RVO:68378271
Klíčová slova: aerolysin nanopore * single-molecule detection * model peptides * folding * hydrogen bond
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.164, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/cbic.202000119
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0314931 - 10.0536551 - ÚJF 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Cruz-Garcia, L. - O'Brien, G. - Sipos, B. - Mayes, S. - Tichý, A. - Širák, I. - Davídková, Marie - Marková, M. - Turner, D. J. - Badie, C.
In Vivo Validation of Alternative FDXR Transcripts in Human Blood in Response to Ionizing Radiation.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 21, č. 21 (2020), č. článku 7851. E-ISSN 1422-0067
Institucionální podpora: RVO:61389005
Klíčová slova: nanopore sequencing * biodosimetry * FDXR * alternative transcript * splice variants * ionizing radiation * qPCR * gene expression
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 5.924, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/ijms21217851
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0314319Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0536551.pdf 0 2.3 MB Open Access - CC licence Vydavatelský postprint povolen