Výsledky vyhledávání
- 1.0550181 - MBÚ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Inomura, K. - Masuda, Takako - Eichner, Meri - Rabouille, S. - Zavřel, Tomáš - Červený, Jan - Vancová, Marie - Bernát, Gábor - Armin, G. - Claquin, P. - Kotabová, Eva - Stephan, S. - Suggett, D.J. - Deutsch, C. - Prášil, Ondřej
Quantifying Cyanothece growth under DIC limitation.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 19, č. 2021 (2021), s. 6456-6464. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Cyanothece * DIC * CO2 * Nitrogen fixation * Nitrate * Diurnal Cyanothece * Carbon * Photosynthesis * Quantitative model
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UEK-B); Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 6.155, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021005018?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325969 - 2.0550065 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Polerecky, L. - Eichner, Meri - Masuda, Takako - Zavřel, Tomáš - Rabouille, S. - Campbell, D. A. - Halsey, K.
Calculation and Interpretation of Substrate Assimilation Rates in Microbial Cells Based on Isotopic Composition Data Obtained by nanoSIMS.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, NOV 30 2021 (2021), č. článku 621634. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GJ20-02827Y; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_027/0007990
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: stable isotope probing * assimilation rates * storage inclusions * cell growth model
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03469894/
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325915 - 3.0543490 - ÚVGZ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zavřel, Tomáš - Schoffman, H. - Lukeš, Martin - Fedorko, Jan - Keren, N. - Červený, Jan
Monitoring fitness and productivity in cyanobacteria batch cultures.
Algal Research-Biomass Biofuels and Bioproducts. Roč. 56, JUN (2021), č. článku 102328. ISSN 2211-9264. E-ISSN 2211-9264
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA TA ČR(CZ) TN01000048
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS III - 90123
Institucionální podpora: RVO:86652079 ; RVO:61388971
Klíčová slova: sp pcc 6803 * photosystem-ii * microalgae cultivation * dark respiration * growth-rate * light * phytoplankton * photosynthesis * fluorescence * algae * Batch cultivation * Cyanobacteria * Excitation-emission spectra * Fitness * Metal uptake * Photosynthesis
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 5.276, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211926421001478?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320687 - 4.0542611 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bernát, Gábor - Zavřel, Tomáš - Kotabová, Eva - Kovács, L. - Steinbach, G. - Vörös, J. - Prášil, Ondřej - Somogyi, B. - Toth, V. R.
Photomorphogenesis in the Picocyanobacterium Cyanobium gracile Includes Increased Phycobilisome Abundance Under Blue Light, Phycobilisome Decoupling Under Near Far-Red Light, and Wavelength-Specific Photoprotective Strategies.
Frontiers in Plant Science. Roč. 12, MAR 18 2021 (2021), č. článku 612302. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: cyanobacteria * photosynthesis * light-quality acclimation * pigment composition * imbalance
Obor OECD: Microbiology; Plant sciences, botany (UEK-B)
Impakt faktor: 6.627, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2021.612302/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319993 - 5.0542572 - ÚVGZ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Sukačová, Kateřina - Losak, P. - Brummer, V. - Máša, V. - Vicha, Daniel - Zavřel, Tomáš
Perspective Design of Algae Photobioreactor for Greenhouses-A Comparative Study.
Energies. Roč. 14, č. 5 (2021), č. článku 1338. E-ISSN 1996-1073
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA ČR(CZ) GA18-24397S
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS III - 90123
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: microalgae * biomass * photobioreactors * power consumption * Chlorella * power input * sustainability * lipids * temperature stress * photoinhibition
Obor OECD: Energy and fuels
Impakt faktor: 3.252, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1996-1073/14/5/1338
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319958 - 6.0541527 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Polerecký, L. - Masuda, Takako - Eichner, Meri - Rabouille, S. - Vancová, Marie - Kienhuis, M. V. M. - Bernát, Gábor - Bonomi-Barufi, J. - Campbell, D. A. - Claquin, P. - Červený, Jan - Giordano, Mario - Kotabová, Eva - Kromkamp, J. - Lombardi, A. T. - Lukeš, Martin - Prášil, Ondřej - Stephan, S. - Suggett, D. - Zavřel, Tomáš - Halsey, K. H.
Temporal Patterns and Intra- and Inter-Cellular Variability in Carbon and Nitrogen Assimilation by the Unicellular Cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, FEB 4 (2021), č. článku 620915. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015062; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GJ20-02827Y
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging - 90062
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344 ; RVO:86652079
Klíčová slova: Crocosphaera subtropica * Cyanothece * photosynthesis * carbon fixation * nitrogen fixation * nanoSIMS * tem
Obor OECD: Microbiology; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A); Microbiology (UEK-B)
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.620915/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319085 - 7.0534211 - ÚVGZ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Keating, S. M. - Waltemath, D. - Koenig, M. - Zhang, F. - Draeger, A. - Chaouiya, C. - Bergmann, F. - Finney, A. - Gillespie, C. S. - Helikar, T. - Hoops, S. - Malik-Sheriff, R. S. - Moodie, S. L. - Moraru, I. I. - Myers, C. - Naldi, A. - Olivier, B. G. - Sahle, S. - Schaff, J. C. - Smith, L. P. - Swat, M. J. - Thieffry, D. - Watanabe, L. - Wilkinson, D. J. - Blinov, M. L. - Begley, K. - Faeder, J. R. - Gomez, H. F. - Hamm, T. M. - Inagaki, Y. - Liebermeister, W. - Lister, A. L. - Lucio, D. - Mjolsness, E. - Proctor, C. - Červený, Jan … celkem 53 autorů
SBML Level 3: an extensible format for the exchange and reuse of biological models.
Molecular Systems Biology. Roč. 16, č. 8 (2020), č. článku e9110. ISSN 1744-4292. E-ISSN 1744-4292
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: systems biology * markup language * simulation * standards * software * information * environment * annotation * repository * ontology * computational modeling * file format * interoperability * reproducibility * systems biology
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 11.429, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/msb.20199110
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0312475 - 8.0504331 - ÚVGZ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Zavřel, Tomáš - Faizi, M. - Loureiro, C. - Poschmann, G. - Stuehler, K. - Sinětova, Maria A. - Zorina, A. - Steuer, R. - Červený, Jan
Quantitative insights into the cyanobacterial cell economy.
eLife. Roč. 8, feb (2019), č. článku e42508. ISSN 2050-084X. E-ISSN 2050-084X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-24397S
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS II - 90061
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: sp pcc 6803 * bacterial-growth laws * gene-expression * resource-allocation * chlorophyll fluorescence * trade-offs * light * cultivation * model * photobioreactor
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7.080, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://elifesciences.org/articles/42508
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0295991 - 9.0493286 - ÚVGZ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zavřel, Tomáš - Chmelík, Dominik - Sinětova, Maria A. - Červený, Jan
Spectrophotometric Determination of Phycobiliprotein Content in Cyanobacterium Synechocystis.
Jove-Journal of Visualized Experiments. Roč. 139, sep (2018), č. článku e58076. ISSN 1940-087X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) LM2015055
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: Phycobilisomes * phycobilins * phycocyanobilins * phycocyanin * allophycocyanin * pigments * light harvesting * protein * cyanobacteria * algae * spectrophotometry * extraction
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 1.108, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0286674