Výsledky vyhledávání
- 1.0576802 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Vacek, J. - Zatloukalová, M. - Bartheldyová, E. - Řeha, D. - Minofar, B. - Bednářová, Klára - Renčiuk, Daniel - Coufal, Jan - Fojta, Miroslav - Žádný, Jaroslav - Gessini, A. - Rossi, B. - Storch, J. - Kabeláč, M.
Hexahelicene DNA-binding: Minor groove selectivity, semi-intercalation and chiral recognition.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 250, 1 October 2023 (2023), č. článku 125905. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Grant CEP: GA TA ČR TA04010082; GA MŠk EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:67985858
Klíčová slova: Chirality * Nucleic acids * B-DNA double helix * Semi-intercalation * [6]helicene * Imidazolium
Obor OECD: Organic chemistry; Organic chemistry (UCHP-M)
Impakt faktor: 8.200, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813023028003?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346205 - 2.0569826 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Krepl, Miroslav - Pokorná, Pavlína - Mlýnský, Vojtech - Stadlbauer, Petr - Šponer, Jiří
Spontaneous binding of single-stranded RNAs to RRM proteins visualized by unbiased atomistic simulations with a rescaled RNA force field.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 21 (2022), s. 12480-12496. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-16554S; GA MŠk EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS * REPLICA EXCHANGE * RECOGNITION MOTIFS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.900, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://academic.oup.com/nar/article/50/21/12480/6858795?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0341159 - 3.0569227 - BFÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pokorná, Pavlína - Krepl, Miroslav - Campagne, S. - Šponer, Jiří
Conformational Heterogeneity of RNA Stem-Loop Hairpins Bound to FUS-RNA Recognition Motif with Disordered RGG Tail Revealed by Unbiased Molecular Dynamics Simulations.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 126, č. 45 (2022), s. 9207-9221. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-16554S; GA MŠk EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: FORCE-FIELD * NUCLEIC-ACIDS * AMBER * BACKBONE * BINDING
Obor OECD: Clinical neurology
Impakt faktor: 3.300, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.2c06168
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340609 - 4.0568949 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dobrovodský, Daniel - Daňhel, Aleš - Mothes-Martin, E. - Pratviel, G. - Renčiuk, Daniel - Fojta, Miroslav
Interfacial behaviour of oligodeoxynucleotides prone to G-quadruplex formation on negatively charged electrode surface monitored by electrochemical probes.
Electrochimica acta. Roč. 442, FEB 20 2023 (2023), č. článku 141878. ISSN 0013-4686. E-ISSN 1873-3859
Grant CEP: GA MŠk EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-11252S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * Adsorption * G-quadruplex * Porphyrin * Voltammetry
Obor OECD: Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)
Impakt faktor: 6.600, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0013468623000658?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344339 - 5.0563712 - BFÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Moreira, D. - Leitao, D. - Lopes-Nunes, J. - Santos, T. C. B. - Figueiredo, J. - Miranda, A.I. - Alexandre, D. - Tomaz, C. - Mergny, Jean-Louis - Cruz, C.
G-Quadruplex Aptamer-Ligand Characterization.
Molecules. Roč. 27, č. 20 (2022), č. článku 6781. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA MŠk EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex aptamer * ligands * aptamer-ligand interactions * biophysical techniques
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.600, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1420-3049/27/20/6781
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340583 - 6.0563710 - BFÚ 2023 RIV CN eng J - Článek v odborném periodiku
Chen, J. - Cheng, M. - Stadlbauer, Petr - Šponer, Jiří - Mergny, Jean-Louis - Ju, H. - Zhou, J.
Exploring Sequence Space to Design Controllable G-Quadruplex Topology Switches.
CCS CHEMISTRY. Roč. 4, č. 9 (2022), s. 3036-3050. E-ISSN 2096-5745
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-23718S; GA MŠk EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * G-quadruplex topology * G-switch * sequence composition * structural versatility
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.200, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.chinesechemsoc.org/doi/10.31635/ccschem.021.202101357
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339366 - 7.0563244 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Figueiredo, J. - Carreira-Barral, I. - Quesada, R. - Mergny, Jean-Louis - Cruz, A.
Synthesis and evaluation of 2,9-disubstituted-1,10-phenanthroline derivatives as G-quadruplex binders.
Bioorganic & Medicinal Chemistry. Roč. 73, NOV 1 2022 (2022), č. článku 116971. ISSN 0968-0896. E-ISSN 1464-3391
Grant CEP: GA MŠk EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex structures * derivatives * Biophysical evaluation * In vitro studies * 2 * 9-disubstituted-1 * 10-phenanthroline
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.500, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://reader.elsevier.com/reader/sd/pii/S0968089622003649?token=A4EAFEEB1A2D211C650C572D440F273643EE887CF8238E8B72F14E24D6A6E20A00CA5CE417490443521225405C2455A0&originRegion=eu-west-1&originCreation=20221108091428
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340610 - 8.0561829 - BFÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Jenner, Leon - Peška, Vratislav - Fulnečková, Jana - Sýkorová, Eva
Telomeres and Their Neighbors.
Genes. Roč. 13, č. 9 (2022), č. článku 1663. E-ISSN 2073-4425
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA ČR(CZ) GA19-12607S; GA MŠk EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: satellite * telomere evolution * interstitial telomere sequences * retroelements * subtelomere structure * telomerase RNA * trap
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.500, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4425/13/9/1663
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340718 - 9.0560261 - BFÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dobrovolná, Michaela - Bohalova, Natalia - Peška, Vratislav - Wang, J. - Luo, Y. - Bartas, M. - Volna, A. - Mergny, Jean-Louis - Brázda, Václav
The Newly Sequenced Genome of Pisum sativum Is Replete with Potential G-Quadruplex-Forming Sequences-Implications for Evolution and Biological Regulation.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 15 (2022), č. článku 8482. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA MŠk EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * G4 propensity * chloroplast DNA * sequence prediction
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.600, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/15/8482
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340527 - 10.0558375 - BFÚ 2023 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Santos, T. C. B. - Lopes-Nunes, J. - Alexandre, D. - Miranda, A.I. - Figueiredo, J. - Silva, M. S. - Mergny, Jean-Louis - Cruz, C.
Stabilization of a DNA aptamer by ligand binding.
Biochimie. Roč. 200, SEP 2022 (2022), s. 8-18. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA MŠk EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: oligonucleotide as1411 * nucleolin * complex * rna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.900, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908422001146?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339541