Výsledky vyhledávání
- 1.0635564 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Cucchiarini, A. - Dobrovolná, Michaela - Brázda, Václav - Mergny, Jean-Louis
Analysis of quadruplex propensity of aptamer sequences.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 9 (2025), č. článku gkaf424. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: in-vitro selection * dna aptamers * selex * capture * bias
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://academic.oup.com/nar/article/53/9/gkaf424/8133626?login=trueDOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf424
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0368199 - 2.0617108 - BFÚ 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Dobrovolná, Michaela - Mergny, Jean-Louis - Brázda, Václav
Complete analysis of G-quadruplex forming sequences in the gapless assembly of human chromosome Y.
Biochimie. Roč. 229, FEB 2025 (2025), s. 49-57. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Gapless assembly * Chromosome Y * G-quadruplex * Genome analysis
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3, rok: 2024 ; AIS: 0.729, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908424002335?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2024.10.007
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0368198 - 3.0604216 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kledus, Filip - Dobrovolná, Michaela - Mergny, Jean-Louis - Brázda, Václav
Asymmetric distribution of G-quadruplex forming sequences in genomes of retroviruses.
Scientific Reports. Roč. 15, č. 1 (2025), č. článku 76. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: terminal repeat promoter * rna g-quadruplexes * myc g-quadruplex * dna * nucleolin * binding * transcription * protein
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.nature.com/articles/s41598-024-82613-2DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-024-82613-2
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0368161 - 4.0602185 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Basu, Pritha - Kejnovská, Iva - Gajarský, M. - Šubert, Denis - Mikešová, Tereza - Renčiuk, Daniel - Trantírek, L. - Mergny, Jean-Louis - Vorlíčková, Michaela
RNA G-quadruplex formation in biologically important transcribed regions: can two-tetrad intramolecular RNA quadruplexes be formed?
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 21 (2024), s. 13224-13242. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-29738S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: circular dichroism * DNA * stacking
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://academic.oup.com/nar/article/52/21/13224/7874850?login=true#google_vignetteDOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae927
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0360476 - 5.0600915 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Šislerová, Lucie - Cucchiarini, A. - Mergny, Jean-Louis
G-quadruplex propensity in H. neanderthalensis, H. sapiens and Denisovans mitochondrial genomes.
NAR Genomics and Bioinformatics. Roč. 6, č. 2 (2024), č. článku lqae060. E-ISSN 2631-9268
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: displacement-loop * genetic history * dna * sequence * rna * introgression * mtdna
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 2.536, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://academic.oup.com/nargab/article/6/2/lqae060/7685155?login=trueDOI: https://doi.org/10.1093/nargab/lqae060
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0358184 - 6.0600747 - BFÚ 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Gajarský, M. - Stadlbauer, Petr - Šponer, Jiří - Cucchiarini, A. - Dobrovolná, Michaela - Brázda, Václav - Mergny, Jean-Louis - Trantírek, L. - Zivkovic, M.L.
DNA Quadruplex Structure with a Unique Cation Dependency.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 63, č. 7 (2024), č. článku e202313226. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-23718S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * amber force-field * center-dot-g * molecular-dynamics * nucleic-acids * k+ solution * simulations * insights * reveals
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 16.9, rok: 2024 ; AIS: 3.51, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202313226DOI: https://doi.org/10.1002/anie.202313226
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0358042 - 7.0585257 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Viskova, P. - Istvankova, E. - Ryneš, J. - Dzatko, S. - Loja, T. - Zivkovic, M.L. - Rigo, R. - El-Khoury, R. - Serrano-Chacon, I. - Damha, Masad J. - González, C. - Mergny, Jean-Louis - Foldynová-Trantírková, Silvie - Trantírek, L.
In-cell NMR suggests that DNA i-motif levels are strongly depleted in living human cells.
Nature Communications. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 1992. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: cytosine-rich strand * g-quadruplex * hnrnp ll * molecular switch * gene-expression * loop length * stability * sequences * domains * protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-46221-yDOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-46221-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0358006 - 8.0584422 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Figueiredo, J. - Mergny, Jean-Louis - Cruz, C.
G-quadruplex ligands in cancer therapy: Progress, challenges, and clinical perspectives.
Life Sciences. Roč. 340, MAR 1 2024 (2024), č. článku 122481. ISSN 0024-3205. E-ISSN 1879-0631
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * structure-based design * growth in-vitro * quindoline derivatives * cell-proliferation * pancreatic-cancer * dna structures * inhibitor
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 0.997, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0024320524000705?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.lfs.2024.122481
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353658 - 9.0583721 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Luo, Y. - Granzhan, A. - Marquevielle, J. - Cucchiarini, A. - Lacroix, L. - Amrane, S. - Verga, D. - Mergny, Jean-Louis
Guidelines for G-quadruplexes: I. In vitro characterization.
Biochimie. Roč. 214, NOV 2023 (2023), s. 5-23. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: resonance energy-transfer * single-stranded-dna * rna g-quadruplexes * circular-dichroism * nucleic-acids * thioflavin t * fluorescent-probes
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.3, rok: 2023 ; AIS: 0.726, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908422003443?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2022.12.019
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351718 - 10.0583599 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Mergny, Jean-Louis
Quadruplexes and aging: G4-binding proteins regulate the presence of miRNA in small extracellular vesicles (sEVs).
Biochimie. Roč. 214, NOV 2023 (2023), s. 69-72. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: small-molecule * translation * mechanism * insights * biology * binding * dna * RNA-Binding protein * Exosome
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.3, rok: 2023 ; AIS: 0.726, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908423000147?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2023.01.014
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351605