Výsledky vyhledávání
- 1.0602185 - BFÚ 2025 US eng J - Článek v odborném periodiku
Basu, Pritha - Kejnovská, Iva - Gajarský, M. - Šubert, Denis - Mikešová, Tereza - Renčiuk, Daniel - Trantírek, L. - Mergny, Jean-Louis - Vorlíčková, Michaela
RNA G-quadruplex formation in biologically important transcribed regions: can two-tetrad intramolecular RNA quadruplexes be formed?
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 21 (2024), s. 13224-13242. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-29738S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: circular dichroism * DNA * stacking
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.863, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://academic.oup.com/nar/article/52/21/13224/7874850?login=true#google_vignetteDOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkae927
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0360476 - 2.0600915 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Šislerová, Lucie - Cucchiarini, A. - Mergny, Jean-Louis
G-quadruplex propensity in H. neanderthalensis, H. sapiens and Denisovans mitochondrial genomes.
NAR Genomics and Bioinformatics. Roč. 6, č. 2 (2024), č. článku lqae060. E-ISSN 2631-9268
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: displacement-loop * genetic history * dna * sequence * rna * introgression * mtdna
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 4, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://academic.oup.com/nargab/article/6/2/lqae060/7685155?login=trueDOI: https://doi.org/10.1093/nargab/lqae060
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0358184 - 3.0600747 - BFÚ 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Gajarský, M. - Stadlbauer, Petr - Šponer, Jiří - Cucchiarini, A. - Dobrovolná, Michaela - Brázda, Václav - Mergny, Jean-Louis - Trantírek, L. - Zivkovic, M.L.
DNA Quadruplex Structure with a Unique Cation Dependency.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 63, č. 7 (2024), č. článku e202313226. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-23718S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * amber force-field * center-dot-g * molecular-dynamics * nucleic-acids * k+ solution * simulations * insights * reveals
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 16.1, rok: 2023 ; AIS: 3.764, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202313226DOI: https://doi.org/10.1002/anie.202313226
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0358042 - 4.0585257 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Viskova, P. - Istvankova, E. - Ryneš, J. - Dzatko, S. - Loja, T. - Zivkovic, M.L. - Rigo, R. - El-Khoury, R. - Serrano-Chacon, I. - Damha, Masad J. - González, C. - Mergny, Jean-Louis - Foldynová-Trantírková, Silvie - Trantírek, L.
In-cell NMR suggests that DNA i-motif levels are strongly depleted in living human cells.
Nature Communications. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 1992. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: cytosine-rich strand * g-quadruplex * hnrnp ll * molecular switch * gene-expression * loop length * stability * sequences * domains * protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.7, rok: 2023 ; AIS: 5.66, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.nature.com/articles/s41467-024-46221-yDOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-46221-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0358006 - 5.0584422 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Figueiredo, J. - Mergny, Jean-Louis - Cruz, C.
G-quadruplex ligands in cancer therapy: Progress, challenges, and clinical perspectives.
Life Sciences. Roč. 340, MAR 1 2024 (2024), č. článku 122481. ISSN 0024-3205. E-ISSN 1879-0631
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * structure-based design * growth in-vitro * quindoline derivatives * cell-proliferation * pancreatic-cancer * dna structures * inhibitor
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 5.2, rok: 2023 ; AIS: 0.965, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0024320524000705?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.lfs.2024.122481
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353658 - 6.0583721 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Luo, Y. - Granzhan, A. - Marquevielle, J. - Cucchiarini, A. - Lacroix, L. - Amrane, S. - Verga, D. - Mergny, Jean-Louis
Guidelines for G-quadruplexes: I. In vitro characterization.
Biochimie. Roč. 214, NOV 2023 (2023), s. 5-23. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: resonance energy-transfer * single-stranded-dna * rna g-quadruplexes * circular-dichroism * nucleic-acids * thioflavin t * fluorescent-probes
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.3, rok: 2023 ; AIS: 0.726, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908422003443?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2022.12.019
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351718 - 7.0583599 - BFÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Mergny, Jean-Louis
Quadruplexes and aging: G4-binding proteins regulate the presence of miRNA in small extracellular vesicles (sEVs).
Biochimie. Roč. 214, NOV 2023 (2023), s. 69-72. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: small-molecule * translation * mechanism * insights * biology * binding * dna * RNA-Binding protein * Exosome
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.3, rok: 2023 ; AIS: 0.726, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908423000147?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2023.01.014
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351605 - 8.0583204 - BFÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Dobrovodský, Daniel - Daňhel, Aleš - Renčiuk, Daniel - Mergny, Jean-Louis - Fojta, Miroslav
N-methyl mesoporphyrin IX (NMM) as electrochemical probe for detection of guanine quadruplexes.
Bioelectrochemistry. Roč. 156, April 2024 (2024), č. článku 108611. ISSN 1567-5394. E-ISSN 1878-562X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-11252S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: circular-dichroism * g-quartet * dna * metalloporphyrins * fluorescence * porphyrins
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.8, rok: 2023 ; AIS: 0.727, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567539423002487?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.bioelechem.2023.108611
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351206 - 9.0582377 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Valková, Natalia - Dobrovolná, Michaela - Mergny, Jean-Louis
Abundance of G-Quadruplex Forming Sequences in the Hepatitis Delta Virus Genomes.
ACS Omega. Roč. 9, č. 3 (2024), s. 4096-4101. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rna g-quadruplex * dna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 0.639, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.3c09288DOI: https://doi.org/10.1021/acsomega.3c09288
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352960 - 10.0574950 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Qiu, D. - Cheng, M. - Stadlbauer, Petr - Chen, J. - Langer, M. - Zhang, X. - Gao, Q. - Ju, H. - Šponer, Jiří - Mergny, Jean-Louis - Monchaud, D. - Zhou, J.
Topology of DNA G-Quadruplexes Can Be Harnessed in Holliday Junction-Based DNA Suprastructures to Control and Optimize Their Biocatalytic Properties.
ACS Catalysis. Roč. 13, č. 16 (2023), s. 10722-10733. ISSN 2155-5435. E-ISSN 2155-5435
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA21-23718S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * DNAzyme * Holliday junction * molecular dynamics simulations * catalytic mechanism
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 11.7, rok: 2023 ; AIS: 2.948, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscatal.3c02818DOI: https://doi.org/10.1021/acscatal.3c02818
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349523