Výsledky vyhledávání
- 1.0599397 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pfennig, T. - Kullmann, E. - Zavřel, Tomáš - Nakielski, A. - Ebenhoeh, O. - Červený, Jan - Bernát, G. - Matuszynska, A. B.
Shedding light on blue-green photosynthesis: A wavelength-dependent mathematical model of photosynthesis in iSynechocystis/i sp. PCC 6803.
PLoS Computational Biology. Roč. 20, č. 9 (2024), č. článku e1012445. ISSN 1553-734X. E-ISSN 1553-7358
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018123; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA MŠMT(CZ) LUAUS24149
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: orange carotenoid protein * electron-transport * cyanobacteria * quality * energy * transitions * pathways * pcc-6803 * co2
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1012445DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1012445
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0356867Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Shedding light on blue-green photosynthesis_A wavelength-dependent mathematical model of photosynthesis in.pdf 0 2.9 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0599393 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Höper, D. - Komkova, D. - Zavřel, Tomáš - Steuer, R.
A quantitative description of light-limited cyanobacterial growth using flux balance analysis.
PLoS Computational Biology. Roč. 20, AUG (2024), č. článku e1012280. ISSN 1553-734X. E-ISSN 1553-7358
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: Computational Biology * Cyanobacteria * Metabolic Flux Analysis * photosynthesis * light
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 3.8, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1012280DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1012280
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0356865Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup A quantitative description of light-limited cyanobacterial growth using flux balance analysis.pdf 0 2.5 MB Vydavatelský postprint povolen - 3.0587286 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zavřel, Tomáš - Segečová, Anna - Kovacs, L. - Lukeš, Martin - Novák, Z. - Pohland, A. - Szabó, M. - Somogyi, B. - Prášil, Ondřej - Červený, Jan - Bernát, G.
A Comprehensive Study of Light Quality Acclimation in Synechocystis Sp. PCC 6803.
Plant and Cell Physiology. Roč. 65, č. 8 (2024), s. 1285-1297. ISSN 0032-0781. E-ISSN 1471-9053
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018123; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Institucionální podpora: RVO:86652079 ; RVO:61388971
Klíčová slova: photosystem-ii * chromatic acclimation * growth * cyanobacteria * carbon * stress * cells * gene * Cyanobacteria * Light harvesting * Light quality * Photomorphogenesis * Photosynthesis * State transitions
Obor OECD: Plant sciences, botany; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 3.9, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://academic.oup.com/pcp/advance-article/doi/10.1093/pcp/pcae062/7697223?login=falseDOI: https://doi.org/10.1093/pcp/pcae062
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0356386Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup pcae062.pdf 0 21.5 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 4.0586974 - ÚVGZ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Literáková, Petra - Zavřel, Tomáš - Búzová, Diana - Kaštánek, P. - Červený, Jan
Marine microalgae Schizochytrium demonstrates strong production of essential fatty acids in various cultivation conditions, advancing dietary self-sufficiency.
Frontiers in Nutrition. Roč. 11, MAY (2024), č. článku 1290701. ISSN 2296-861X. E-ISSN 2296-861X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA TA ČR(CZ) TN02000044
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: docosahexaenoic acid * limacinum * glycerol * omega-3 * model * water * dha * docosahexaenoic acid * unicellular eukaryote * growth * optimization * health supplements * bioreactors * process automation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fnut.2024.1290701/fullDOI: https://doi.org/10.3389/fnut.2024.1290701
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0354330Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup fnut-11-1290701.pdf 0 1.5 MB Vydavatelský postprint povolen - 5.0580096 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Espinoza-Corral, R. - Iwai, M. - Zavřel, Tomáš - Lechno-Yossef, S. - Sutter, M. - Červený, Jan - Niyogi, K. K. - Kerfeld, C.A.
Phycobilisome protein ApcG interacts with PSII and regulates energy transfer in Synechocystis.
Plant Physiology. Roč. 194, č. 3 (2024), s. 1383-1396. ISSN 0032-0889. E-ISSN 1532-2548
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: sp pcc 6803 * state transition * excitation-energy * light * chlorophyll * expression * model * photosynthesis * fluorescence * ultrastructure
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 6.5, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://academic.oup.com/plphys/advance-article/doi/10.1093/plphys/kiad615/7424862?login=trueDOI: https://doi.org/10.1093/plphys/kiad615
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353074 - 6.0577721 - ÚVGZ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Sukačová, Kateřina - Szotkowski, M. - Pařil, P. - Mareš, J. - Touš, M. - Vícha, Daniel - Polášek, M. - Márová, I. - Zavřel, Tomáš
Simultaneous production of γ-linolenic acid and carotenoids by a novel microalgal strain isolated from the underexplored habitat of intermittent streams.
Algal Research-Biomass Biofuels and Bioproducts. Roč. 71, APR (2023), č. článku 103055. ISSN 2211-9264. E-ISSN 2211-9264
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: microalgae * pseudomuriella engadinensis * essential fatty acids * γ-linolenic acid * lutein
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211926423000887?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.algal.2023.103055
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346840 - 7.0572613 - MBÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Rodrigues, J. S. - Kovács, L. - Lukeš, Martin - Hoper, R. - Steuer, R. - Červený, Jan - Lindberg, P. - Zavřel, Tomáš
Characterizing isoprene production in cyanobacteria-Insights into the effects of light, temperature, and isoprene on Synechocystis sp. PCC 6803.
Bioresource Technology. Roč. 380, JUL 2023 (2023), č. článku 129068. ISSN 0960-8524. E-ISSN 1873-2976
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: Biofuels * Cultivation conditions * Optimization * Thermotolerance * Flux Balance Analysis
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UEK-B)
Impakt faktor: 9.7, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852423004947?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129068
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347180Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 1-s2.0-S0960852423004947-main.pdf 1 2.5 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 8.0550181 - MBÚ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Inomura, K. - Masuda, Takako - Eichner, Meri - Rabouille, S. - Zavřel, Tomáš - Červený, Jan - Vancová, Marie - Bernát, Gábor - Armin, G. - Claquin, P. - Kotabová, Eva - Stephan, S. - Suggett, D.J. - Deutsch, C. - Prášil, Ondřej
Quantifying Cyanothece growth under DIC limitation.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 19, č. 2021 (2021), s. 6456-6464. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Cyanothece * DIC * CO2 * Nitrogen fixation * Nitrate * Diurnal Cyanothece * Carbon * Photosynthesis * Quantitative model
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UEK-B); Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 6.155, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021005018?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.11.036
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325969 - 9.0550065 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Polerecky, L. - Eichner, Meri - Masuda, Takako - Zavřel, Tomáš - Rabouille, S. - Campbell, D. A. - Halsey, K.
Calculation and Interpretation of Substrate Assimilation Rates in Microbial Cells Based on Isotopic Composition Data Obtained by nanoSIMS.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, NOV 30 2021 (2021), č. článku 621634. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GJ20-02827Y; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_027/0007990
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: stable isotope probing * assimilation rates * storage inclusions * cell growth model
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
Web výsledku:
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03469894/DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.621634
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325915 - 10.0543490 - ÚVGZ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zavřel, Tomáš - Schoffman, H. - Lukeš, Martin - Fedorko, Jan - Keren, N. - Červený, Jan
Monitoring fitness and productivity in cyanobacteria batch cultures.
Algal Research-Biomass Biofuels and Bioproducts. Roč. 56, JUN (2021), č. článku 102328. ISSN 2211-9264. E-ISSN 2211-9264
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA TA ČR(CZ) TN01000048
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS III - 90123
Institucionální podpora: RVO:86652079 ; RVO:61388971
Klíčová slova: sp pcc 6803 * photosystem-ii * microalgae cultivation * dark respiration * growth-rate * light * phytoplankton * photosynthesis * fluorescence * algae * Batch cultivation * Cyanobacteria * Excitation-emission spectra * Fitness * Metal uptake * Photosynthesis
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 5.276, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
Web výsledku:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211926421001478?via%3DihubDOI: https://doi.org/10.1016/j.algal.2021.102328
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320687