Výsledky vyhledávání
- 1.0368063 - ÚOCHB 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dobeš, Petr - Řezáč, Jan - Fanfrlík, Jindřich - Otyepka, M. - Hobza, Pavel
Semiempirical Quantum Mechanical Method PM6-DH2X Describes the Geometry and Energetics of CK2-Inhibitor Complexes Involving Halogen Bonds Well, While the Empirical Potential Fails.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 115, č. 26 (2011), s. 8581-8589. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA ČR GAP208/11/0295
Grant ostatní: European Social Fund(XE) CZ.1.05/2.1.00/03.0058
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: PM6-DH2X * halogen bonding * scoring
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.696, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0006699 - 2.0368013 - ÚOCHB 2012 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Pecina, Adam - Přenosil, Ondřej - Fanfrlík, Jindřich - Řezáč, Jan - Granatier, Jaroslav - Hobza, Pavel - Lepšík, Martin
On the reliability of the corrected semiempirical quantum chemical method (PM6-DH2) for assigning the protonation states in HIV-1 protease/inhibitor complexes.
Collection of Czechoslovak Chemical Communications. Roč. 76, č. 5 (2011), s. 457-479. ISSN 0010-0765
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA MŠMT 1M0508; GA ČR GAP208/11/0295
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: HIV-1 protease inhibition * protonation * QM/MM calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 1.283, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0202490 - 3.0367999 - ÚOCHB 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kolář, Michal - Kubař, T. - Hobza, Pavel
On the Role of London Dispersion Forces in Biomolecular Structure Determination.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 115, č. 24 (2011), s. 8038-8046. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA ČR GAP208/11/0295
Grant ostatní: Korea Science and Ingineering Foundation(KR) R32-2008-000-10180-0; European Scince Found(XE) CZ.1.05/2.1.00/03.0058
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: dispersion interaction * DNA * molecular dynamics
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.696, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0006696 - 4.0367993 - ÚOCHB 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kolář, Michal - Fanfrlík, Jindřich - Hobza, Pavel
Ligand Conformational and Solvation/Desolvation Free Energy in Protein-Ligand Complex Formation.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 115, č. 16 (2011), s. 4718-4724. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA ČR GAP208/11/0295
Grant ostatní: Korea Science and Engineering Foundation(KR) R32-2008-000-10180-0; European Science Fund(XE) CZ.1.05/2.1.00/03.0058
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: solvation free energy * SMD * HIV protease inhibitors
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.696, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0006695 - 5.0365166 - ÚOCHB 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jílková, Adéla - Řezáčová, Pavlína - Lepšík, Martin - Horn, Martin - Váchová, Jana - Fanfrlík, Jindřich - Brynda, Jiří - McKerrow, J. H. - Caffrey, C. R. - Mareš, Michael
Structural Basis for Inhibition of Cathepsin B Drug Target from the Human Blood Fluke, Schistosoma mansoni.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 286, č. 41 (2011), s. 35770-35881. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA ČR GA203/09/1585; GA ČR GAP208/11/0295; GA MŠMT OC09007
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50520514
Klíčová slova: cathepsin B * schistosoma * crystal structure
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 4.773, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0200472 - 6.0360708 - ÚOCHB 2012 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Dobeš, Petr - Fanfrlík, Jindřich - Řezáč, Jan - Otyepka, M. - Hobza, Pavel
Transferable scoring function based on semiempirical quantum mechanical PM6-DH2 method: CDK2 with 15 structurally diverse inhibitors.
Journal of Computer-Aided Molecular Design. Roč. 25, č. 3 (2011), s. 223-235. ISSN 0920-654X. E-ISSN 1573-4951
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA ČR GAP208/11/0295
Grant ostatní: European Social Fund(XE) CZ.1.05/2.1.00/03.0058
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: CDK2 * semiempirical quantum mechanical method PM6-DH2 * drug design
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.386, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0198195