Výsledky vyhledávání
- 1.0580096 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Espinoza-Corral, R. - Iwai, M. - Zavřel, Tomáš - Lechno-Yossef, S. - Sutter, M. - Červený, Jan - Niyogi, K. K. - Kerfeld, C.A.
Phycobilisome protein ApcG interacts with PSII and regulates energy transfer in Synechocystis.
Plant Physiology. Roč. 194, č. 3 (2024), s. 1383-1396. ISSN 0032-0889. E-ISSN 1532-2548
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: sp pcc 6803 * state transition * excitation-energy * light * chlorophyll * expression * model * photosynthesis * fluorescence * ultrastructure
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 7.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://academic.oup.com/plphys/advance-article/doi/10.1093/plphys/kiad615/7424862?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353074 - 2.0579023 - ÚVGZ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Búzová, Diana - Fröhlich, J. - Zapletalová, D. - Raffaele, M. - Lo Re, O. - Tsoneva, D.K. - Štěrba, J. - Červený, Jan - Vinciguerra, M.
Detection of cell-free histones in the cerebrospinal fluid of pediatric central nervous system malignancies by imaging flow cytometry.
Frontiers in molecular biosciences. Roč. 10, NOV (2023), č. článku 1254699. E-ISSN 2296-889X
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU23-03-00318
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: childhood-cancer * liquid biopsy * brain-tumors * medulloblastoma * landscape * dna * histones * pediatric brain tumors * liquid biopsy * epigenetics * imaging
Obor OECD: Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Impakt faktor: 5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmolb.2023.1254699/full
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347897Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup fmolb-10-1254699.pdf 5 1 MB Vydavatelský postprint povolen - 3.0572629 - ÚVGZ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Rebej, M. - Juřena, T. - Vondál, J. - Fuente Herraiz, D. - Červený, Jan - Jegla, Z.
Numerical simulations and validation of single- and two-phase flow in a stirred lab-scale photobioreactor.
Biosystems Engineering. Roč. 230, JUN (2023), s. 35-50. ISSN 1537-5110. E-ISSN 1537-5129
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: cfd * multiphase flow * photobioreactor * PIV validation * shear stress * agitation
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 5.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S153751102300079X?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343262 - 4.0572613 - MBÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Rodrigues, J. S. - Kovács, L. - Lukeš, Martin - Hoper, R. - Steuer, R. - Červený, Jan - Lindberg, P. - Zavřel, Tomáš
Characterizing isoprene production in cyanobacteria-Insights into the effects of light, temperature, and isoprene on Synechocystis sp. PCC 6803.
Bioresource Technology. Roč. 380, JUL 2023 (2023), č. článku 129068. ISSN 0960-8524. E-ISSN 1873-2976
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: Biofuels * Cultivation conditions * Optimization * Thermotolerance * Flux Balance Analysis
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UEK-B)
Impakt faktor: 11.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852423004947?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347180 - 5.0567478 - ÚVGZ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Búzová, Diana - Braghini, M. R. - Bianco, S. D. - Lo Re, O. - Raffaele, M. - Fröhlich, J. - Kisheva, A. - Crudele, A. - Mosca, A. - Sartorelli, M. R. - Balsano, C. - Červený, Jan - Mazza, T. - Alisi, A. - Vinciguerra, M.
Profiling of cell-free DNA methylation and histone signatures in pediatric NAFLD: A pilot study.
Hepatology Communications. Roč. 6, č. 12 (2022), s. 3311-3323. E-ISSN 2471-254X
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS III - 90123
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: NONALCOHOLIC FATTY LIVER * DISEASE * STEATOHEPATITIS * DIAGNOSIS * VALIDATION * MACROH2A1 * BIOPSY
Obor OECD: Health-related biotechnology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://aasldpubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/hep4.2082
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338726Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Profiling of cell-free DNA methylation and histone signatures in pediatric NAFLD_A pilot study.pdf 2 3.5 MB Vydavatelský postprint povolen - 6.0550181 - MBÚ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Inomura, K. - Masuda, Takako - Eichner, Meri - Rabouille, S. - Zavřel, Tomáš - Červený, Jan - Vancová, Marie - Bernát, Gábor - Armin, G. - Claquin, P. - Kotabová, Eva - Stephan, S. - Suggett, D.J. - Deutsch, C. - Prášil, Ondřej
Quantifying Cyanothece growth under DIC limitation.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 19, č. 2021 (2021), s. 6456-6464. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Cyanothece * DIC * CO2 * Nitrogen fixation * Nitrate * Diurnal Cyanothece * Carbon * Photosynthesis * Quantitative model
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UEK-B); Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 6.155, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021005018?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325969 - 7.0543490 - ÚVGZ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zavřel, Tomáš - Schoffman, H. - Lukeš, Martin - Fedorko, Jan - Keren, N. - Červený, Jan
Monitoring fitness and productivity in cyanobacteria batch cultures.
Algal Research-Biomass Biofuels and Bioproducts. Roč. 56, JUN (2021), č. článku 102328. ISSN 2211-9264. E-ISSN 2211-9264
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA TA ČR(CZ) TN01000048
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS III - 90123
Institucionální podpora: RVO:86652079 ; RVO:61388971
Klíčová slova: sp pcc 6803 * photosystem-ii * microalgae cultivation * dark respiration * growth-rate * light * phytoplankton * photosynthesis * fluorescence * algae * Batch cultivation * Cyanobacteria * Excitation-emission spectra * Fitness * Metal uptake * Photosynthesis
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 5.276, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211926421001478?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320687 - 8.0542698 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Rabouille, S. - Campbell, Douglas Andrew - Masuda, Takako - Zavřel, Tomáš - Bernát, Gábor - Polerecky, L. - Halsey, K. - Eichner, Meri - Kotabová, Eva - Stephan, S. - Lukeš, Martin - Claquin, P. - Bonomi-Barufi, J. - Lombardi, A. T. - Červený, Jan - Suggett, D. - Giordano, Mario - Kromkamp, J. C. - Prášil, Ondřej
Electron & Biomass Dynamics of Cyanothece Under Interacting Nitrogen & Carbon Limitations.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, APR 9 2021 (2021), č. článku 617802. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_027/0007990; GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA ČR(CZ) GA19-00973S
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: Cyanothece * Crocosphaera subtropica * photosynthesis * light limitation * carbon limitation * nitrogen fixation
Obor OECD: Microbiology; Plant sciences, botany (UEK-B)
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.617802/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320072 - 9.0541527 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Polerecký, L. - Masuda, Takako - Eichner, Meri - Rabouille, S. - Vancová, Marie - Kienhuis, M. V. M. - Bernát, Gábor - Bonomi-Barufi, J. - Campbell, D. A. - Claquin, P. - Červený, Jan - Giordano, Mario - Kotabová, Eva - Kromkamp, J. - Lombardi, A. T. - Lukeš, Martin - Prášil, Ondřej - Stephan, S. - Suggett, D. - Zavřel, Tomáš - Halsey, K. H.
Temporal Patterns and Intra- and Inter-Cellular Variability in Carbon and Nitrogen Assimilation by the Unicellular Cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, FEB 4 (2021), č. článku 620915. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015062; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA ČR(CZ) GA20-17627S; GA ČR(CZ) GJ20-02827Y
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging - 90062
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344 ; RVO:86652079
Klíčová slova: Crocosphaera subtropica * Cyanothece * photosynthesis * carbon fixation * nitrogen fixation * nanoSIMS * tem
Obor OECD: Microbiology; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A); Microbiology (UEK-B)
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.620915/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319085 - 10.0534211 - ÚVGZ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Keating, S. M. - Waltemath, D. - Koenig, M. - Zhang, F. - Draeger, A. - Chaouiya, C. - Bergmann, F. - Finney, A. - Gillespie, C. S. - Helikar, T. - Hoops, S. - Malik-Sheriff, R. S. - Moodie, S. L. - Moraru, I. I. - Myers, C. - Naldi, A. - Olivier, B. G. - Sahle, S. - Schaff, J. C. - Smith, L. P. - Swat, M. J. - Thieffry, D. - Watanabe, L. - Wilkinson, D. J. - Blinov, M. L. - Begley, K. - Faeder, J. R. - Gomez, H. F. - Hamm, T. M. - Inagaki, Y. - Liebermeister, W. - Lister, A. L. - Lucio, D. - Mjolsness, E. - Proctor, C. - Červený, Jan … celkem 53 autorů
SBML Level 3: an extensible format for the exchange and reuse of biological models.
Molecular Systems Biology. Roč. 16, č. 8 (2020), č. článku e9110. ISSN 1744-4292. E-ISSN 1744-4292
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA ČR(CZ) GA18-24397S; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: systems biology * markup language * simulation * standards * software * information * environment * annotation * repository * ontology * computational modeling * file format * interoperability * reproducibility * systems biology
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 11.429, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/msb.20199110
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0312475