0523463 - ÚMG 2020 RIV CZ cze Z - Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda/plemeno
Kolář, Michal
Protokol o ověření technologie zpracování sekvenačních dat za účelem vizualizace - Extended Cross-Population heatmap.
[Protocol on verification of sequencing data processing technology for visualization - Extended Cross-Population heatmap.]
Interní kód: TG01010066-V3-6 ; 2019
Technické parametry: EXPheatmap je softwarová knihovna programovacího jazyka Python 3, která umožňuje zpracovat (nejenom) genomická populační data poskytnutá ve standardní formě tak, aby došlo k vizualizaci výsledků komplexních mezipopulačních vztahů. Hlavní důraz je zde kladen na přehlednou prezentaci dat, která jsou typicky vysoce mnohorozměrná. Knihovna zahrnuje i funkce použitelné na předzpracování dat a statistické posouzení dat (výpočet a transformace p hodnot). Tyto funkcionality výrazně zjednodušší uživatelům analýzu sekvenačních dat.
Ekonomické parametry: Výsledek je využíván zejména řešitelem dotace na jehož pracovišti dosahují díky využití výsledku reálné úspory zhruba 10.000,- Kč až 100.000,- Kč ročně podle intenzity práce s výsledkem v konkrétní laboratoři řešitele.
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TG01010066
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Cross-Population * heatmap * visualization
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307818