Výsledky vyhledávání
- 1.0587733 - BÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Schille, L. - Valdés-Correcher, E. - Archaux, F. - Balacenoiu, F. - Bjørn, M. C. - Bogdziewicz, M. - Boivin, T. - Branco, M. - Damestoy, T. - de Groot, M. - Dobrosavljević, J. - Duduman, M.-L. - Dulaurent, A.-M. - Green, S. - Grünwald, J. - Eötvös, C. B. - Faticov, M. - Fernandez-Conradi, P. - Flury, E. - Funosas, D. - Galmán, A. - Gossner, M. M. - Gripenberg, S. - Grosu, L. - Hagge, J. - Hampe, A. - Harvey, D. - Houston, R. - Isenmann, R. - Kavčič, A. - Kozlov, M. V. - Lanta, Vojtěch - Le Tilly, B. - Lopez-Vaamonde, C. - Mallick, S. - Mäntylä, Elina - Mårell, A. - Milanović, S. - Molnár, M. - Moreira, X. - Moser, V. - Mrázová, Anna - Musolin, D. L. - Perot, T. - Piotti, A. - Popova, A. V. - Prinzing, A. - Pukinskaya, L. - Sallé, A. - Sam, Kateřina - Sedikhin, N. V. - Shabarova, Tatiana … celkem 61 autorů
Decomposing drivers in avian insectivory: Large-scale effects of climate, habitat and bird diversity.
Journal of Biogeography. Roč. 51, č. 6 (2024), s. 1079-1094. ISSN 0305-0270. E-ISSN 1365-2699
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07533S; GA ČR(CZ) GX19-28126X
GRANT EU: European Commission(XE) 805189 - BABE
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:67985939
Klíčová slova: bird predation * insect herbivory * oak trees
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 3.4, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1111/jbi.14808
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0354838 - 2.0583805 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kavagutti, Vinicius Silva - Bulzu, Paul-Adrian - Chiriac, Maria-Cecilia - Salcher, Michaela M. - Mukherjee, Indranil - Shabarova, Tatiana - Grujčič, Vesna - Mehrshad, Maliheh - Kasalický, Vojtěch - Andrei, A.S. - Jezberová, Jitka - Seďa, Jaromír - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Šimek, Karel - Ghai, Rohit
High-resolution metagenomic reconstruction of the freshwater spring bloom.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 15. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR GA22-03662S; GA ČR(CZ) GA19-23261S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: bacterioplankton populations * seasonal succession * giant virus * chrysochromulina
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 13.8, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-022-01451-4
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351803 - 3.0583794 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Park, Hongjae - Shabarova, Tatiana - Salcher, Michaela M. - Kosová, Lenka - Rychtecký, Pavel - Mukherjee, Indranil - Šimek, Karel - Porcal, Petr - Seďa, Jaromír - Znachor, Petr - Kasalický, Vojtěch
In the right place, at the right time: the integration of bacteria into the Plankton Ecology Group model.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 112. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GA19-00113S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR GA22-33245S; GA ČR GF22-35826K
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: rna gene-sequences * niche separation * Freshwater reservoirs * Microbial communities * Spatiotemporal dynamics * Microdiversity * PEG model
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 13.8, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-023-01522-0
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351793 - 4.0552451 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Shabarova, Tatiana - Salcher, Michaela M. - Porcal, Petr - Znachor, Petr - Nedoma, Jiří - Grossart, H.P. - Seďa, Jaromír - Hejzlar, Josef - Šimek, Karel
Recovery of freshwater microbial communities after extreme rain events is mediated by cyclic succession.
Nature Microbiology. Roč. 6, č. 4 (2021), s. 479-+. ISSN 2058-5276. E-ISSN 2058-5276
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-23718Y; GA ČR(CZ) GA19-00113S; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: dissolved organic-matter * ribosomal-rna * peg-model * lake * assemblages * phosphorus * projections * reservoirs * emissions * silva
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 30.964, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1038/s41564-020-00852-1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0327580Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup SHABAROVA NatureMicrobiol 2021.pdf 0 13.8 MB Autorský preprint vyžádat - 5.0546949 - MBÚ 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mujakić, Izabela - Andrei, Adrian-Stefan - Shabarova, Tatiana - Kolesár Fecskeová, Lívia - Salcher, Michaela M. - Piwosz, Kasia - Ghai, Rohit - Koblížek, Michal
Common Presence of Phototrophic Gemmatimonadota in Temperate Freshwater Lakes.
mSystems. Roč. 6, č. 2 (2021), č. článku e01241-20. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA ČR(CZ) GJ20-23718Y; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Grant ostatní: AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Gemmatimonadota * Gemmatimonadetes * anoxygenic phototrophs * aquatic bacteria * MAGs * metagenome * photosynthesis gene cluster * freshwater ecology * card-fish
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 7.328, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.01241-20
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0323331 - 6.0539257 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mukherjee, Indranil - Salcher, Michaela M. - Andrei, Adrian-Stefan - Kavagutti, Vinicius Silva - Shabarova, Tatiana - Grujcic, V. - Haber, Markus - Layoun, Paul - Hodoki, Y. - Nakano, S. - Šimek, Karel - Ghai, Rohit
A freshwater radiation of diplonemids.
Environmental Microbiology. Roč. 22, č. 11 (2020), s. 4658-4668. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA ČR(CZ) GA19-23469S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * microbial eukaryotes * marine * community * diversity
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.491, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/1462-2920.15209
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316927Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup MUKHERJEE Environ Microbiol 2020.pdf 0 1 MB Autorský preprint povolen - 7.0531454 - MBÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Shabarova, Tatiana - Pernthaler, J. - Posch, T. - Šimek, Karel - Porcal, Petr - Salcher, Michaela M.
Bacterial and Eukaryotic Small-Subunit Amplicon Data Do Not Provide a Quantitative Picture of Microbial Communities, but They Are Reliable in the Context of Ecological Interpretations.
mSphere. Roč. 5, č. 2 (2020), č. článku e00052-20. ISSN 2379-5042. E-ISSN 2379-5042
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-14095Y; GA ČR(CZ) GJ20-23718Y; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-00113S; GA ČR(CZ) GA19-23469S
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: CARD-FISH * amplicon sequencing * bacterial communities
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 4.389, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://msphere.asm.org/content/5/2/e00052-20
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0310116 - 8.0495997 - MBÚ 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Shabarova, Tatiana - Tomasch, J. - Šimek, Karel - Kopejtka, Karel - Kahl, S. - Pieper, D. H. - Koblížek, Michal
Determining lineage-specific bacterial growth curves with a novel approach based on amplicon reads normalization using internal standard (ARNIS).
The ISME Journal. Roč. 12, č. 11 (2018), s. 2640-2654. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR GA15-12197S; GA ČR GA13-11281S; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA MŠMT(CZ) LO1416; GA MŠMT(CZ) ED2.1.00/19.0392
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: FRESH-WATER RESERVOIR= * SPRING PHYTOPLANKTON BLOOM * IN-SITU HYBRIDIZATION
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.493, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288835Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 135 Determining lineage-specific bacterial growth curves.pdf 5 2.7 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 9.0495062 - BC 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Grujčič, Vesna - Hahn, M.W. - Horňák, Karel - Jezberová, Jitka - Kasalický, Vojtěch - Nedoma, Jiří - Salcher, Michaela M. - Shabarova, Tatiana
Bacterial prey food characteristics modulate community growth response of freshwater bacterivorous flagellates.
Limnology and Oceanography. Roč. 63, č. 1 (2018), s. 484-502. ISSN 0024-3590. E-ISSN 1939-5590
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: spring phytoplankton bloom * in-situ hybridization * bacterioplankton populations * metazoan zooplankton * genus limnohabitans
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.325, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288084 - 10.0495058 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Grujčič, Vesna - Nuy, J.K. - Salcher, Michaela M. - Shabarova, Tatiana - Kasalický, Vojtěch - Boenigk, J. - Jensen, M. - Šimek, Karel
Cryptophyta as major bacterivores in freshwater summer plankton.
The ISME Journal. Roč. 12, č. 7 (2018), s. 1668-1681. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: in-situ hybridization * ribosomal-rna genes * community composition * protist diversity * functional diversity
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.493, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288083