Počet záznamů: 1
DeutEx
- 1.
SYSNO ASEP 0550855 Druh ASEP L4 - Software Zařazení RIV R - Software Název DeutEx Tvůrce(i) Kavan, Daniel (MBU-M) RID, ORCID
Kádek, Alan (MBU-M) RID, ORCID
Kruppa, G. H. (US)
Man, Petr (MBU-M) RID, ORCIDRok vydání 2021 Int.kód DeutEx Technické parametry Samostatný program sestavený v jazyce java fungující na běžných výpočetních strojích pod systémy Unix/Linux, Windows a MAC OC Ekonomické parametry Zvýšení prostupnosti analýz a snazší interpretace dat v HDX-MS analýzách. Název vlastníka Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. IČ vlastníka 61388971 Požad. na licenč. popl. A - Poskytovatel licence požaduje licenční poplatek Jazyk dok. eng - angličtina Země vlastníka CZ - Česká republika Klíč. slova Java application ; mass spectrometric data ; hydrogen/deuterium exchange Vědní obor RIV CE - Biochemie Obor OECD Biochemical research methods CEP GA19-16084S GA ČR - Grantová agentura ČR GA16-24309S GA ČR - Grantová agentura ČR GA16-20860S GA ČR - Grantová agentura ČR GF16-34818L GA ČR - Grantová agentura ČR GAP206/12/0503 GA ČR - Grantová agentura ČR LD15089 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Institucionální podpora MBU-M - RVO:61388971 Anotace Anotace v jazyce práceDeutEx is a Java-based standalone application enabling fully automated processing of mass spectrometric data from hydrogen/deuterium exchange experiments. It has three main interfaces where user can perform 1) peptide mapping – assembly of the main input file for subsequent calculations, 2) manage the data and organize them according to experimental conditions, 3) run the calculation, fully review and export the resulting data. The program needs LCMS data exported in text files and can be thus compatible with a majority of MS instrumentation. The output is either graphical (uptake plots) or simple text files organized according to the community guidelines or compatible with a web-based application MSTools. The program calculates percentage of deuteration, number of exchanged deuterons, signal intensity and peak-width. It can manage numerous experimental conditions, replicates and different protein sequences. It can handle any protein modification and mutations.
Pracoviště Mikrobiologický ústav Kontakt Eliška Spurná, eliska.spurna@biomed.cas.cz, Tel.: 241 062 231 Rok sběru 2022 Elektronická adresa www.deutex.org
Počet záznamů: 1