Počet záznamů: 1

Analysis of two abundant, highly related satellites in the allotetraploid Nicotiana arentsii using double-strand conformation polymorphism analysis and sequencing

SYSNO ASEP	0370431
Druh ASEP	J - Článek v odborném periodiku
Zařazení RIV	J - Článek v odborném periodiku
Poddruh J	Článek ve WOS
Název	Analysis of two abundant, highly related satellites in the allotetraploid Nicotiana arentsii using double-strand conformation polymorphism analysis and sequencing
Tvůrce(i)	Matyášek, Roman (BFU-R)_ORCID Fulneček, Jaroslav (BFU-R) Leitch, A.R. (GB) Kovařík, Aleš (BFU-R)_{RID, ORCID}
Celkový počet autorů	4
Zdroj.dok.	New Phytologist - ISSN 0028-646X Roč. 192, č. 3 (2011), s. 747-759
Poč.str.	13 s.
Jazyk dok.	eng - angličtina
Země vyd.	US - Spojené státy americké
Klíč. slova	DNA-curvature ; subtelomeric satellite repeats ; allopolyploidy
Vědní obor RIV	BO - Biofyzika
CEP	GA206/09/1751 GA ČR - Grantová agentura ČR
	GAP501/10/0208 GA ČR - Grantová agentura ČR
	LC06004 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
CEZ	AV0Z50040507 - BFU-R (2005-2011)
	AV0Z50040702 - BFU-R (2007-2013)
UT WOS	000296850800020
DOI	10.1111/j.1469-8137.2011.03827.x
Anotace	In allotetraploid Nicotiana arentsii, we examined the fate of homologous subtelomeric satellites NUNSSP and NWISSP inherited from diploid progenitors N. undulata and N. wigandioides, respectively. While the NUNSSP monomers were highly homogeneous in nucleotide sequences, the NWISSP monomers formed two separate clades. Likewise, the genomic NUNSSP monomers showed less DNA conformation heterogeneity than NWISSP monomers, with distinct conformations. Sequence, structural and chromosomal features of the parental satellites were faithfully inherited by N. arentsii. Our study revealed that inter-genomic homogenisation of subtelomeric satellite repeats does not occur in N. arentsii allotetraploid. We propose that the sequence and structural divergence of subtelomeric satellites may render allopolyploid chromosomes less vulnerable to intergenomic exchanges.
Pracoviště	Biofyzikální ústav
Kontakt	Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244
Rok sběru	2012

Počet záznamů: 1