Počet záznamů: 1
The DF-LCCSD(T0) correction of the .fi./.psi. force field dihedral parameters significantly influences the free energy profile of the alanine dipeptide
- 1.
SYSNO ASEP 0369287 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název The DF-LCCSD(T0) correction of the .fi./.psi. force field dihedral parameters significantly influences the free energy profile of the alanine dipeptide Tvůrce(i) Vymětal, Jiří (UOCHB-X) RID, ORCID
Vondrášek, Jiří (UOCHB-X) RID, ORCIDCelkový počet autorů 2 Zdroj.dok. Chemical Physics Letters. - : Elsevier - ISSN 0009-2614
Roč. 503, 4/6 (2011), s. 301-304Poč.str. 4 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. NL - Nizozemsko Klíč. slova conformational preferences ; quantum-mechanics ; gas-phase ; simulations ; peptides Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP GAP208/10/0725 GA ČR - Grantová agentura ČR LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LH11020 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011) UT WOS 000287187800024 DOI 10.1016/j.cplett.2011.01.030 Anotace The conformational behavior of small peptides is mostly dictated by backbone rigidity, in which the phi/psi torsions seem to play the most important role. We show that ab initio-based corrections of the torsion parameters in the FF-FOM force field determined by the DF-LCCSD(T0) method significantly influence the quality and minimum localization on the 2D free energy surface of the alanine dipeptide (AD) along the phi and psi coordinates of the backbone torsion angles. The populations of the individual conformers are in good agreement with the experimental results published recently on the AD through an analysis of the amide III band and the Raman skeletal vibrations. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Viktorie Chládková, Tel.: 232 002 434 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1