Počet záznamů: 1
Semiempirical Quantum Mechanical Method PM6-DH2X Describes the Geometry and Energetics of CK2-Inhibitor Complexes Involving Halogen Bonds Well, While the Empirical Potential Fails
- 1.
SYSNO ASEP 0368063 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Semiempirical Quantum Mechanical Method PM6-DH2X Describes the Geometry and Energetics of CK2-Inhibitor Complexes Involving Halogen Bonds Well, While the Empirical Potential Fails Tvůrce(i) Dobeš, Petr (UOCHB-X)
Řezáč, Jan (UOCHB-X) RID, ORCID
Fanfrlík, Jindřich (UOCHB-X) RID, ORCID
Otyepka, M. (CZ)
Hobza, Pavel (UOCHB-X) RID, ORCIDCelkový počet autorů 5 Zdroj.dok. Journal of Physical Chemistry B. - : American Chemical Society - ISSN 1520-6106
Roč. 115, č. 26 (2011), s. 8581-8589Poč.str. 9 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova PM6-DH2X ; halogen bonding ; scoring Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GAP208/11/0295 GA ČR - Grantová agentura ČR CEZ AV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011) UT WOS 000292281200025 DOI 10.1021/jp202149z Anotace Complexes of CK2 protein kinase with halogenated inhibitors were investigated by means of the advanced semiempirical quantum mechanical PM6-DH2X method. The PM6-DH2X method provides reliable geometries of the CK2 protein kinase-inhibitor complexes that agree well with the X-ray crystal structures. When the Amber empirical potential is applied, this agreement becomes considerably worse. Similarly, the binding free energies determined by the PM6-DH2X SQM method are much closer to the experimental inhibition constants than those based on the Amber empirical potential. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Viktorie Chládková, Tel.: 232 002 434 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1