Počet záznamů: 1
On the Role of London Dispersion Forces in Biomolecular Structure Determination
- 1.
SYSNO ASEP 0367999 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název On the Role of London Dispersion Forces in Biomolecular Structure Determination Tvůrce(i) Kolář, Michal (UOCHB-X) RID, ORCID
Kubař, T. (DE)
Hobza, Pavel (UOCHB-X) RID, ORCIDCelkový počet autorů 3 Zdroj.dok. Journal of Physical Chemistry B. - : American Chemical Society - ISSN 1520-6106
Roč. 115, č. 24 (2011), s. 8038-8046Poč.str. 9 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova dispersion interaction ; DNA ; molecular dynamics Vědní obor RIV CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GAP208/11/0295 GA ČR - Grantová agentura ČR CEZ AV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011) UT WOS 000291709500038 DOI 10.1021/jp202878d Anotace A DNA dodecamer and the methyladenine...methylthymine complex in aqueous environment have been studied by means of molecular dynamics simulation, with a modified force field accounting for the hypothetical absence of London dispersion forces. While the hydrophobic effect of the solvent accounts for the sufficient stabilization of the complex, the appearance of the native biomolecular conformation is attributed to the London dispersion forces. Thus, the London dispersion seems to provide the native structure of a biomolecular complex with the largest additional stabilization, preferring it among several possible aggregated structures. The observations are affected by the construction of the modified force field, and this effect is discussed thoroughly as well as the description of nonbonded interactions with the current biomolecular force fields. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Viktorie Chládková, Tel.: 232 002 434 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1