Počet záznamů: 1  

On the Role of London Dispersion Forces in Biomolecular Structure Determination

  1. 1.
    SYSNO ASEP0367999
    Druh ASEPJ - Článek v odborném periodiku
    Zařazení RIVJ - Článek v odborném periodiku
    Poddruh JČlánek ve WOS
    NázevOn the Role of London Dispersion Forces in Biomolecular Structure Determination
    Tvůrce(i) Kolář, Michal (UOCHB-X) RID, ORCID
    Kubař, T. (DE)
    Hobza, Pavel (UOCHB-X) RID, ORCID
    Celkový počet autorů3
    Zdroj.dok.Journal of Physical Chemistry B. - : American Chemical Society - ISSN 1520-6106
    Roč. 115, č. 24 (2011), s. 8038-8046
    Poč.str.9 s.
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Země vyd.US - Spojené státy americké
    Klíč. slovadispersion interaction ; DNA ; molecular dynamics
    Vědní obor RIVCF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
    CEPLC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
    GAP208/11/0295 GA ČR - Grantová agentura ČR
    CEZAV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011)
    UT WOS000291709500038
    DOI10.1021/jp202878d
    AnotaceA DNA dodecamer and the methyladenine...methylthymine complex in aqueous environment have been studied by means of molecular dynamics simulation, with a modified force field accounting for the hypothetical absence of London dispersion forces. While the hydrophobic effect of the solvent accounts for the sufficient stabilization of the complex, the appearance of the native biomolecular conformation is attributed to the London dispersion forces. Thus, the London dispersion seems to provide the native structure of a biomolecular complex with the largest additional stabilization, preferring it among several possible aggregated structures. The observations are affected by the construction of the modified force field, and this effect is discussed thoroughly as well as the description of nonbonded interactions with the current biomolecular force fields.
    PracovištěÚstav organické chemie a biochemie
    Kontaktasep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Viktorie Chládková, Tel.: 232 002 434
    Rok sběru2012
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.