Počet záznamů: 1
Explaining the varied glycosidic conformational, G-tract length and sequence preferences for anti-parallel G-quadruplexes
- 1.
SYSNO ASEP 0365887 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Explaining the varied glycosidic conformational, G-tract length and sequence preferences for anti-parallel G-quadruplexes Tvůrce(i) Cang, X. (US)
Šponer, Jiří (BFU-R) RID, ORCID
Cheatham III, T.E. (US)Celkový počet autorů 3 Zdroj.dok. Nucleic Acids Research. - : Oxford University Press - ISSN 0305-1048
Roč. 39, č. 10 (2011), s. 4499-4512Poč.str. 14 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova quantum chemistry ; DNA ; quadruplex Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP LC06030 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy IAA400040802 GA AV ČR - Akademie věd GA203/09/1476 GA ČR - Grantová agentura ČR CEZ AV0Z50040507 - BFU-R (2005-2011) AV0Z50040702 - BFU-R (2007-2013) UT WOS 000291063500048 DOI 10.1093/nar/gkr031 Anotace Guanine-rich DNA sequences tend to form four-stranded G-quadruplex structures. Characteristic glycosidic conformational patterns along the G-strands, such as the 50-syn-anti-syn-anti pattern observed with the Oxytricha nova telomeric G-quadruplexes, have been well documented. However, an explanation for these featured glycosidic patterns has not emerged. This work presents MD simulation and free energetic analyses for simplified two-quartet [d(GG)]4 models and suggests that the four base pair step patterns show quite different relative stabilities: syn-anti>anti-anti>anti-syn->syn-syn. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1