Počet záznamů: 1
Unlocking the Barley Genome by Chromosomal and Comparative Genomics
- 1.
SYSNO ASEP 0365200 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Unlocking the Barley Genome by Chromosomal and Comparative Genomics Tvůrce(i) Mayer, K. F. X. (DE)
Martis, M. (DE)
Hedley, P. E. (GB)
Šimková, Hana (UEB-Q) RID, ORCID
Liu, H. (GB)
Morris, J. A. (GB)
Steuernagel, B. (DE)
Taudien, S. (DE)
Kubaláková, Marie (UEB-Q) RID
Suchánková, Pavla (UEB-Q) RID
Doležel, Jaroslav (UEB-Q) RID, ORCID
Stein, N. (DE)Celkový počet autorů 28 Zdroj.dok. Plant Cell. - : Oxford University Press - ISSN 1040-4651
Roč. 23, č. 4 (2011), s. 1249-1263Poč.str. 15 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova PSEUDO-RESPONSE-REGULATOR ; ACETYL-COA CARBOXYLASE ; TRITICUM-AESTIVUM L. Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie CEZ AV0Z50380511 - UEB-Q (2005-2011) UT WOS 000291000500010 DOI 10.1105/tpc.110.082537 Anotace We used a novel approach that incorporated chromosome sorting, next-generation sequencing, array hybridization, and systematic exploitation of conserved synteny with model grasses to assign -86% of the estimated -32,000 barley (Hordeum vulgare) genes to individual chromosome arms. Using a series of bioinformatically constructed genome zippers that integrate gene indices of rice (Oryza sativa), sorghum (Sorghum bicolor), and Brachypodium distachyon in a conserved synteny model, we were able to assemble 21,766 barley genes in a putative linear order. We show that the barley (H) genome displays a mosaic of structural similarity to hexaploid bread wheat (Triticum aestivum) A, B, and D subgenomes and that orthologous genes in different grasses exhibit signatures of positive selection in different lineages. We present an ordered, information-rich scaffold of the barley genome that provides a valuable and robust framework for the development of novel strategies in cereal breeding. Pracoviště Ústav experimentální botaniky Kontakt David Klier, knihovna@ueb.cas.cz, Tel.: 220 390 469 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1