Počet záznamů: 1
Detekce mikroorganismů v půdě a miocénním sedimentu metodou CARD-FISH (Catalyzed Reporter Deposition - Fluorescence in situ Hybridization)
- 1.
SYSNO ASEP 0352505 Druh ASEP C - Konferenční příspěvek (mezinárodní konf.) Zařazení RIV D - Článek ve sborníku Název Detekce mikroorganismů v půdě a miocénním sedimentu metodou CARD-FISH (Catalyzed Reporter Deposition - Fluorescence in situ Hybridization) Překlad názvu Detection of microorganisms in soil and Miocene sediment using CARD-FISH method (Catalyzed Reporter Deposition – Fluorescence in situ Hybridization) Tvůrce(i) Dohnalová, Ludmila (BC-A)
Kasalický, Vojtěch (BC-A) RID, ORCID
Chroňáková, Alica (BC-A) RID, ORCID
Krištůfek, Václav (BC-A) RIDZdroj.dok. Mikrobiológia vody 2009, Zborník prednášok a posterov. - Bratislava : Československá spoločnosť mikrobiologická, 2009 - ISBN 978-80-970269-9-8 Rozsah stran s. 149-157 Poč.str. 9 s. Akce Mikrobiológia vody 2009 Datum konání 30.09.2009-02.10.2009 Místo konání Poprad Země SK - Slovensko Typ akce EUR Jazyk dok. cze - čeština Země vyd. SK - Slovensko Klíč. slova detection of microorganisms ; soil sediment ; CARD-FISH method Vědní obor RIV EH - Ekologie - společenstva CEP LC06066 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy IAA600660605 GA AV ČR - Akademie věd GA206/09/1642 GA ČR - Grantová agentura ČR GA526/09/1570 GA ČR - Grantová agentura ČR CEZ AV0Z60660521 - UPB-H, BC-A (2005-2011) AV0Z60170517 - HBU-Z, BC-A (2005-2011) Anotace Pomocí metody CARD-FISH (catalyzed reporter deposition – fluorescence in situ hybridization) bylo detekováno zastoupení specifických skupin prokaryot (Domény: Archea a Bacteria, Kmeny: Actinobacteria a Firmicutes; methanotrofní bakterie I a II typu) ve dvou odlišných prostředích: v půdě podhorských pastvin (farma Borová, Česká republika) a v miocenním sedimentu (hnědouhelný lom, Sokolov, Česká republika). Výsledky byly porovnány s celkovým počtem bakterií (DAPI) a počtem kolonií bakterií (CFU). Metoda CARD-FISH se ukázala vhodnou pro detekci mikroorganismů v půdě podhorských pastvin. Avšak při detekci mikroorganismů v miocénním sedimentu se nepodařilo zoptimalizovat metodu tak, aby vysoký obsah jílových částic nebránil počítání DAPI obarvených buňek. Fluorescenční signál hybridizovaných buňek byl naopak zřetelný. Na optimalizaci metody se nadále pracuje. Překlad anotace The CARD-FISH (catalyzed reporter deposition – fluorescence in situ hybridization) method together with total bacterial counts (DAPI), colony forming units (CFU) was used to determine the prokaryotic community composition in two different types of samples: upland pasture soil (farm Borová, Czech Republic) and Miocene sediment (Sokolov Brown Coal Basin, Czech Republic). The occurrence of Archaea, Bacteria and major bacterial group (Actinobacteria, Firmicutes) as well as some specific functional groups (type I methanotrophs, type II methanotrophs) were studied. CARD-FISH analysis used to detection of microorganisms in pasture soil was applicable without any problems. Miocene sediment negatively influenced signal intensities of DAPI-stained cells, but not hybridized ones. Strategies for overcoming this problem are developed. Pracoviště Biologické centrum (od r. 2006) Kontakt Dana Hypšová, eje@eje.cz, Tel.: 387 775 214 Rok sběru 2011
Počet záznamů: 1